280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1572 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  100 
 
 
492 aa  964    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  99.59 
 
 
492 aa  961    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  38.05 
 
 
516 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  36.47 
 
 
516 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.41 
 
 
527 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1333  hypothetical protein  36.29 
 
 
480 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  33.78 
 
 
534 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  35.73 
 
 
490 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1329  hypothetical protein  36.51 
 
 
480 aa  269  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  35.73 
 
 
490 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  35.73 
 
 
490 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  35.73 
 
 
490 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  35.73 
 
 
490 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  34.02 
 
 
489 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  34.02 
 
 
489 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  33.81 
 
 
489 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  33.81 
 
 
489 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  33.81 
 
 
489 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  33.81 
 
 
489 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  33.81 
 
 
489 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  33.81 
 
 
489 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  33.81 
 
 
489 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.94 
 
 
539 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  32.75 
 
 
539 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.83 
 
 
544 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  32.94 
 
 
539 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  32.94 
 
 
539 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  31.95 
 
 
500 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  35.24 
 
 
544 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  32.09 
 
 
500 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  31.67 
 
 
500 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  31.19 
 
 
501 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  31.19 
 
 
501 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  32.01 
 
 
502 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  31.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  31.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  31.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  31.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  31.19 
 
 
501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  31.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  31.67 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  30.08 
 
 
506 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  31.19 
 
 
501 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  31.19 
 
 
501 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  31.46 
 
 
500 aa  246  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  31.46 
 
 
500 aa  246  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.67 
 
 
506 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  31.63 
 
 
514 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  34.83 
 
 
462 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  34.83 
 
 
462 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  31.73 
 
 
501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  31.73 
 
 
488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  31.73 
 
 
511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  31.87 
 
 
506 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  32.4 
 
 
501 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  33.06 
 
 
510 aa  236  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  29.81 
 
 
495 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  31.16 
 
 
495 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  30.12 
 
 
584 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  30.06 
 
 
499 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
520 aa  228  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  32.85 
 
 
504 aa  226  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  34.96 
 
 
461 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  33.6 
 
 
461 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.49 
 
 
512 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.49 
 
 
512 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.18 
 
 
483 aa  225  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  31.5 
 
 
510 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  31.92 
 
 
497 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  33 
 
 
524 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  32.33 
 
 
528 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  32.37 
 
 
479 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  32.85 
 
 
528 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  31.76 
 
 
507 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  31.2 
 
 
517 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  31.25 
 
 
497 aa  222  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  33.84 
 
 
501 aa  222  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.34 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.21 
 
 
496 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  31.85 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  34.55 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.2 
 
 
499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  36.1 
 
 
432 aa  220  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  31.29 
 
 
507 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  28.83 
 
 
494 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  30.89 
 
 
497 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  31.2 
 
 
517 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 
477 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  31.91 
 
 
504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.91 
 
 
516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  34.92 
 
 
461 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  31.82 
 
 
501 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  31.82 
 
 
501 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  32.03 
 
 
501 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  32.28 
 
 
461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  32.09 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  32.09 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  32.09 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  32.09 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  32.35 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>