249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0514 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  99.32 
 
 
292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  40.62 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  40.62 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  38.68 
 
 
317 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  38.15 
 
 
330 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  38.15 
 
 
329 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  36.76 
 
 
291 aa  205  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  38.95 
 
 
318 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  39.3 
 
 
281 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  39 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  38.7 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  37.41 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  39.84 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  39.84 
 
 
359 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  38.24 
 
 
293 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  39.34 
 
 
294 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  37.15 
 
 
328 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  40.76 
 
 
254 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  38.58 
 
 
333 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  38.18 
 
 
309 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 
300 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  40.64 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  39.27 
 
 
286 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  39.68 
 
 
286 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  43.44 
 
 
310 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  39.39 
 
 
277 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  36.05 
 
 
299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  36.63 
 
 
296 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  38.15 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  36.52 
 
 
334 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  40.34 
 
 
243 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  38.83 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  39.18 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
296 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  36.65 
 
 
351 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  38.21 
 
 
295 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 
338 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 
336 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 
336 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 
336 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  36.67 
 
 
331 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  36.67 
 
 
331 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  36.67 
 
 
331 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  37.35 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  37.72 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  37.35 
 
 
316 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  34.32 
 
 
285 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  38.4 
 
 
407 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
353 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
353 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
353 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
326 aa  158  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  34.96 
 
 
310 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  34.69 
 
 
288 aa  156  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  34.91 
 
 
355 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  37.41 
 
 
327 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  37.78 
 
 
334 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  36.99 
 
 
383 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 
311 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  36.89 
 
 
448 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 
327 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
361 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
367 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
338 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  33.08 
 
 
336 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  31.99 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 
279 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 
279 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  33.78 
 
 
346 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  31.77 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
305 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
305 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  33.08 
 
 
356 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  33.08 
 
 
356 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  32.71 
 
 
355 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 
358 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 
306 aa  122  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>