More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0717 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 330 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  93.77 
 
 		 322 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  77.21 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  76.89 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  76.14 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  76.14 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  75.76 
 
 		 291 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  75.76 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  75.09 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  75.76 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  75.76 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  74.91 
 
 		 303 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  74.53 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  74.53 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  70.42 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  74.42 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  74.7 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  72.94 
 
 		 304 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  43.93 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  43.93 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  42.61 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.93 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  41.78 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  40.6 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.93 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  41.95 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  41.81 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  40.81 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  36.3 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  34.35 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.17 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  37.23 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.97 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  34.35 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  37.88 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  32.21 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.92 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  35.66 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  35.66 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  34.02 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  35.96 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  30.61 
 
 		 398 aa  122  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  32.95 
 
 		 511 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.07 
 
 		 301 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.24 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  30.83 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  27.07 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.72 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.26 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.46 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.35 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  28.69 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  33.54 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.19 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  30.37 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.37 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.41 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  30.64 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  28.98 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 		 515 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 		 515 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  26.76 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  27.07 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  24.58 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>