83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4830 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  63.12 
 
 		 152 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  60.47 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  34.62 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  37.01 
 
 		 254 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.71 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  37.3 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.61 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.61 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.61 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  35.43 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  35.43 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.61 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  34.65 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.4 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  28.24 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  36.22 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 391 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.64 
 
 		 369 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 440 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  33.33 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  34.92 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  29.92 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.43 
 
 		 452 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  32.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  32.06 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  31.54 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  30.16 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  36 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  36 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  35.43 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.87 
 
 		 378 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  35.2 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  31.75 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.87 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1199  ribonuclease HI  38.16 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0115399  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  34.13 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 378 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  33.07 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  28.46 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  28.47 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  30.3 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  29.92 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  29.92 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  31.2 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.16 
 
 		 427 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  27.69 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  31.2 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  33.77 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  25.42 
 
 		 388 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  32.33 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  30.77 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  26.92 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  26.57 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 401 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  36.36 
 
 		 220 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  26.32 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  40.98 
 
 		 170 aa  42  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  27.27 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  23.21 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  32.33 
 
 		 149 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  28.99 
 
 		 145 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  35.85 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  25.35 
 
 		 2805 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  35.06 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  28.78 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  26.36 
 
 		 302 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  30.61 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  30.26 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  30.07 
 
 		 241 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>