65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2552 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  40 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  40 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  36.88 
 
 		 722 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  38.74 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  37.59 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  35.95 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  37.34 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  35.95 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  33.33 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  35.95 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  37.34 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  40.18 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  35.34 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  36.88 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  36.03 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  35.94 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  32.64 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  34.96 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  50.82 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  50.82 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  50.82 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  41.11 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  32.48 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  35.86 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  38.46 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  38.02 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  34.53 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  46.15 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  50 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  50.94 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  32.61 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  43.4 
 
 		 129 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  37.16 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  36.45 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  50 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  31.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  34.83 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  49.15 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.53 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  46 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  42.86 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  44 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  31.4 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  50 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  58 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  41.27 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  41.43 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  43.4 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  45.83 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  41.67 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  54.35 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  48.89 
 
 		 140 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  30.68 
 
 		 157 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  40.68 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  40 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  38.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  42.86 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  37.5 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  43.06 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  32 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  31.87 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  44.9 
 
 		 219 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>