123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6511 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 77 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  64.47 
 
 		 78 aa  96.7  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  70.15 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  61.29 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  56.72 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  61.19 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  59.7 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  54.84 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  57.14 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2993  Phage transcriptional regulator, AlpA  46.88 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  46.97 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  52.73 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  52.94 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  50.98 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  50.98 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  42.42 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  39.19 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  56 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  48.21 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  45.61 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  0.0000168687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  39.13 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  38.57 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  42.86 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  56.52 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  40.32 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  46.3 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  44.64 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  54 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  44.64 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1759  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  46.43 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2371  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  48.08 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  45.1 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  44.07 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  52.08 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  45.1 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  39.06 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  42.11 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  43.1 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  43.86 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  36 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  43.48 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  36.73 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  44.74 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1689  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211878  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0103  hypothetical protein  35.19 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0118  hypothetical protein  35.19 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4519  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2424  hypothetical protein  43.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1935  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  38.78 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  39.22 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  42.5 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3333  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>