More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4637 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  77.58 
 
 		 421 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  77.58 
 
 		 421 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  78.34 
 
 		 397 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  100 
 
 		 397 aa  796    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  78.34 
 
 		 397 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  77.58 
 
 		 397 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  77.83 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  79.6 
 
 		 445 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  50 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  50.9 
 
 		 391 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.94 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.91 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  44.64 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.44 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  44.64 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.91 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.44 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.44 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.44 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.44 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.91 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.44 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  48.02 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  46.95 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  48.02 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  47.76 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.8 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  45.05 
 
 		 393 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.8 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.2 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.15 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  44.11 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  44.11 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  45.62 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  44.11 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  43.1 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  45.36 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  44.56 
 
 		 399 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  47.49 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.42 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.12 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  46.19 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.4 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  46.49 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  46.49 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  46.49 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  46.49 
 
 		 400 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  43.11 
 
 		 386 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  47.38 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  44.42 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  45.45 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  51.52 
 
 		 292 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  45.45 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  45.45 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  45.96 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  45.97 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  45.96 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  45.96 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  45.96 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  45.24 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  45.24 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  45.24 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  42.54 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  45.77 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  45.77 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  45.77 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  42.39 
 
 		 411 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  45.77 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  45.1 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  42.39 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  43.77 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  43.8 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  44.07 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  40.66 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  44.88 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  43.14 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  44.03 
 
 		 388 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  46.63 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  44.1 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  45.11 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  41.22 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  42.67 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  42.45 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  42.97 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.13 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  42.18 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  43.92 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  43.92 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  43.41 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  42.29 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  42.18 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  43.65 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>