More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1166 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  100 
 
 		 896 aa  1837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  64.29 
 
 		 835 aa  1161    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  45.98 
 
 		 744 aa  353  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  45.59 
 
 		 739 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  45.34 
 
 		 736 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  38.95 
 
 		 509 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  39.32 
 
 		 695 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  34.17 
 
 		 413 aa  221  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  31.09 
 
 		 489 aa  195  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  33.76 
 
 		 815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  33.76 
 
 		 815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  31.13 
 
 		 789 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  33.44 
 
 		 806 aa  168  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  34.45 
 
 		 788 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  34.45 
 
 		 788 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  33.84 
 
 		 818 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  32.26 
 
 		 781 aa  159  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  29.11 
 
 		 892 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  32.76 
 
 		 789 aa  146  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  32.08 
 
 		 736 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  27.49 
 
 		 812 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  30.88 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  27.19 
 
 		 761 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  28.87 
 
 		 697 aa  121  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  28.22 
 
 		 400 aa  115  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  29.18 
 
 		 833 aa  114  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  26.52 
 
 		 725 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  25.81 
 
 		 476 aa  104  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  35.39 
 
 		 746 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  34.98 
 
 		 848 aa  95.9  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  31.82 
 
 		 338 aa  94.4  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.91 
 
 		 431 aa  94.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  29.8 
 
 		 778 aa  92.8  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  32.08 
 
 		 272 aa  92.8  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  33.06 
 
 		 297 aa  90.1  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  31.3 
 
 		 277 aa  87.8  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  34.87 
 
 		 275 aa  87.4  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  34.5 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  36.9 
 
 		 818 aa  84  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  27.69 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  31.74 
 
 		 782 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  36.59 
 
 		 1557 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  36.59 
 
 		 1389 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  30.65 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  31.1 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1077 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  28.87 
 
 		 986 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  60 
 
 		 776 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  61.02 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1448 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  55.56 
 
 		 769 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  27.95 
 
 		 1448 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  60 
 
 		 765 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  57.63 
 
 		 802 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  55.56 
 
 		 973 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 896 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  58.33 
 
 		 786 aa  69.3  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  55.93 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  58.33 
 
 		 786 aa  69.3  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  58.73 
 
 		 774 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  58.73 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  55.93 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  60.32 
 
 		 775 aa  69.3  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.06 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  57.63 
 
 		 777 aa  69.3  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  55.93 
 
 		 914 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  55.93 
 
 		 913 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 917 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  57.14 
 
 		 959 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  61.02 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  58.06 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  55.93 
 
 		 928 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  55 
 
 		 782 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 1187 aa  68.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 755 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  56.92 
 
 		 1369 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  55.93 
 
 		 1342 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.12 
 
 		 1174 aa  68.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  60 
 
 		 1784 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.12 
 
 		 1157 aa  67.8  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.92 
 
 		 1485 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  60 
 
 		 1834 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  60 
 
 		 1725 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  60 
 
 		 1725 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  60 
 
 		 1851 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  60 
 
 		 1725 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.07 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  60 
 
 		 1851 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  56.92 
 
 		 1430 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  60 
 
 		 1725 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  54.24 
 
 		 1368 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  58.33 
 
 		 1107 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.92 
 
 		 1527 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  61.02 
 
 		 1673 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.92 
 
 		 1527 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.92 
 
 		 1640 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>