More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2388 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  53.78 
 
 		 786 aa  751    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.58 
 
 		 733 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.54 
 
 		 807 aa  1189    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.67 
 
 		 834 aa  1216    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.02 
 
 		 837 aa  707    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.69 
 
 		 917 aa  679    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  67.89 
 
 		 917 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  70.36 
 
 		 844 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.63 
 
 		 789 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  53.37 
 
 		 781 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.99 
 
 		 781 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  52.02 
 
 		 768 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.35 
 
 		 818 aa  672    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  66.4 
 
 		 879 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  46.11 
 
 		 855 aa  690    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.28 
 
 		 769 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.4 
 
 		 786 aa  732    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  50.51 
 
 		 770 aa  693    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  67.68 
 
 		 911 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  80.2 
 
 		 801 aa  1297    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  49.87 
 
 		 777 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.1 
 
 		 866 aa  823    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  58.04 
 
 		 769 aa  842    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  67.2 
 
 		 928 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  51.05 
 
 		 777 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  52.17 
 
 		 776 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.75 
 
 		 799 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  52.09 
 
 		 822 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  51.25 
 
 		 794 aa  786    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  52.03 
 
 		 794 aa  781    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  79.83 
 
 		 801 aa  1296    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.89 
 
 		 819 aa  1218    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  50.89 
 
 		 768 aa  730    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  53.51 
 
 		 774 aa  732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.66 
 
 		 1202 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  52.47 
 
 		 757 aa  696    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.05 
 
 		 776 aa  691    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.28 
 
 		 917 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  52.09 
 
 		 822 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  54.06 
 
 		 814 aa  735    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  79.2 
 
 		 802 aa  1274    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  51.96 
 
 		 778 aa  771    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  52.52 
 
 		 769 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  52.51 
 
 		 784 aa  759    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.99 
 
 		 849 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.38 
 
 		 821 aa  751    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  86.14 
 
 		 973 aa  884    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  50.39 
 
 		 779 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.27 
 
 		 831 aa  1217    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  51.82 
 
 		 776 aa  720    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.28 
 
 		 917 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.22 
 
 		 850 aa  737    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.87 
 
 		 841 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  52.09 
 
 		 819 aa  727    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.13 
 
 		 781 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  100 
 
 		 802 aa  1627    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  52.02 
 
 		 768 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  52.09 
 
 		 822 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.02 
 
 		 769 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.1 
 
 		 784 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  57.09 
 
 		 782 aa  803    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.51 
 
 		 787 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  52.8 
 
 		 765 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  49.62 
 
 		 781 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.81 
 
 		 770 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  53.11 
 
 		 771 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.07 
 
 		 932 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.48 
 
 		 896 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  68.16 
 
 		 1085 aa  699    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.2 
 
 		 769 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  62.79 
 
 		 1014 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  51.71 
 
 		 775 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  52.02 
 
 		 768 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.12 
 
 		 763 aa  728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  49.4 
 
 		 837 aa  703    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.28 
 
 		 917 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.28 
 
 		 769 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.89 
 
 		 784 aa  764    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.63 
 
 		 837 aa  739    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.47 
 
 		 786 aa  769    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  64.26 
 
 		 1120 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  81.34 
 
 		 804 aa  1265    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  52.09 
 
 		 822 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  51.96 
 
 		 778 aa  771    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  67.89 
 
 		 914 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  67.34 
 
 		 913 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  55.2 
 
 		 789 aa  800    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.4 
 
 		 884 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  53.78 
 
 		 786 aa  751    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.26 
 
 		 769 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0756  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.13 
 
 		 803 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0143018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  81.34 
 
 		 811 aa  1257    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.47 
 
 		 779 aa  717    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.28 
 
 		 917 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  52.33 
 
 		 755 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.99 
 
 		 770 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  64.46 
 
 		 1107 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  61.87 
 
 		 1299 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.65 
 
 		 1157 aa  635  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  64.53 
 
 		 1123 aa  635  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>