More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2127 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  71.29 
 
 
1342 aa  720    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.29 
 
 
1329 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  71.89 
 
 
1310 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.52 
 
 
834 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  71.02 
 
 
917 aa  1285    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.89 
 
 
1310 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  65.79 
 
 
844 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02116  cell division protein FtsK  54.65 
 
 
831 aa  795    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00337191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  53.34 
 
 
855 aa  892    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  71.89 
 
 
1299 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  57.19 
 
 
879 aa  955    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  66.25 
 
 
1120 aa  736    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.48 
 
 
917 aa  1296    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  81.42 
 
 
841 aa  1362    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  71.19 
 
 
911 aa  1285    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  50.54 
 
 
801 aa  764    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  71.29 
 
 
1310 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  45.66 
 
 
777 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.76 
 
 
866 aa  769    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.25 
 
 
837 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  85.58 
 
 
850 aa  1461    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.23 
 
 
1157 aa  727    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  69.62 
 
 
1091 aa  725    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  50.79 
 
 
794 aa  749    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  50.79 
 
 
794 aa  749    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  50.18 
 
 
801 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  71.29 
 
 
1369 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  46.66 
 
 
774 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.37 
 
 
917 aa  1295    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  70.58 
 
 
1379 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  67.07 
 
 
802 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.25 
 
 
786 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  67.75 
 
 
973 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  49.28 
 
 
814 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  50.24 
 
 
802 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  48.01 
 
 
778 aa  678    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  62.69 
 
 
1014 aa  736    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.59 
 
 
917 aa  1296    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.85 
 
 
786 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.87 
 
 
821 aa  690    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.47 
 
 
807 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  71.08 
 
 
1342 aa  718    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.88 
 
 
1202 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.27 
 
 
896 aa  1315    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.37 
 
 
917 aa  1295    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.44 
 
 
789 aa  704    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  64.4 
 
 
786 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  49.88 
 
 
782 aa  737    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  71.29 
 
 
1329 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  64.4 
 
 
786 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.06 
 
 
784 aa  635    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  71.08 
 
 
1360 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.38 
 
 
932 aa  1208    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  70.18 
 
 
1244 aa  716    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  65.2 
 
 
1085 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  72.03 
 
 
960 aa  739    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  71.29 
 
 
1329 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.02 
 
 
1145 aa  706    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  49.21 
 
 
769 aa  723    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  100 
 
 
837 aa  1708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.52 
 
 
831 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  69.01 
 
 
1187 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  70.58 
 
 
1358 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.5 
 
 
837 aa  931    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.48 
 
 
819 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  71.29 
 
 
1368 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  70.58 
 
 
1360 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  45.64 
 
 
755 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  71.54 
 
 
914 aa  1290    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  71.62 
 
 
913 aa  1288    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  66.4 
 
 
789 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  84.23 
 
 
884 aa  921    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.94 
 
 
849 aa  1363    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.71 
 
 
1174 aa  717    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  71.29 
 
 
1342 aa  720    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  66.06 
 
 
811 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  83.04 
 
 
928 aa  947    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  66.06 
 
 
804 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  71.08 
 
 
1321 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  48.01 
 
 
778 aa  678    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  46.62 
 
 
776 aa  633  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  63.86 
 
 
784 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  46.26 
 
 
781 aa  631  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.94 
 
 
917 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.47 
 
 
799 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  44.12 
 
 
768 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  60.19 
 
 
769 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.49 
 
 
770 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.34 
 
 
763 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.32 
 
 
1707 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  60.49 
 
 
771 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.31 
 
 
733 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  62.22 
 
 
1369 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  62.7 
 
 
1725 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  62.7 
 
 
1725 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.96 
 
 
779 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  62.7 
 
 
1725 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  62.7 
 
 
1834 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  62.9 
 
 
1784 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62 
 
 
908 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>