More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1693 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.35 
 
 
779 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.34 
 
 
834 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  66.6 
 
 
917 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.4 
 
 
917 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  52.91 
 
 
844 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.87 
 
 
917 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  52.13 
 
 
781 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.99 
 
 
784 aa  759    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  53.28 
 
 
768 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  67.79 
 
 
879 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  55.76 
 
 
786 aa  761    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.04 
 
 
831 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.95 
 
 
776 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  66.21 
 
 
911 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  56.49 
 
 
801 aa  851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.39 
 
 
866 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  53.28 
 
 
822 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  48.77 
 
 
855 aa  731    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.05 
 
 
770 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  59.42 
 
 
769 aa  854    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.74 
 
 
837 aa  716    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.58 
 
 
781 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  53.28 
 
 
822 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  52.52 
 
 
794 aa  768    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  50.8 
 
 
794 aa  768    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  56.37 
 
 
801 aa  850    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.68 
 
 
819 aa  811    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  51.1 
 
 
768 aa  702    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  62.15 
 
 
1091 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  51.34 
 
 
774 aa  694    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.01 
 
 
789 aa  794    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  51.4 
 
 
757 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.4 
 
 
917 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  53.28 
 
 
822 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  52.62 
 
 
814 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  56.06 
 
 
802 aa  837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  50.98 
 
 
778 aa  751    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  50.98 
 
 
778 aa  751    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  53.02 
 
 
769 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.9 
 
 
769 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.85 
 
 
807 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  53.28 
 
 
822 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.51 
 
 
821 aa  733    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  65.88 
 
 
973 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  48.53 
 
 
777 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.4 
 
 
917 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  51.99 
 
 
776 aa  735    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  51.1 
 
 
770 aa  680    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.13 
 
 
850 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.4 
 
 
917 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  55.76 
 
 
786 aa  761    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  53.41 
 
 
819 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.94 
 
 
896 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.75 
 
 
786 aa  773    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.33 
 
 
781 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  100 
 
 
782 aa  1581    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  56.58 
 
 
804 aa  830    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  52.04 
 
 
765 aa  690    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  48.89 
 
 
781 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.9 
 
 
769 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  52.37 
 
 
771 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.02 
 
 
932 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.13 
 
 
841 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  66.22 
 
 
1085 aa  699    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  51.6 
 
 
775 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.54 
 
 
763 aa  725    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  53.28 
 
 
768 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  53.28 
 
 
768 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.25 
 
 
849 aa  731    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.09 
 
 
769 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.98 
 
 
786 aa  728    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.86 
 
 
837 aa  688    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  56.47 
 
 
802 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  48.95 
 
 
776 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.07 
 
 
799 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.78 
 
 
770 aa  670    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  66.6 
 
 
914 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  66.6 
 
 
913 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  55.08 
 
 
789 aa  805    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.48 
 
 
884 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  66.93 
 
 
837 aa  670    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.03 
 
 
769 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  53.73 
 
 
784 aa  754    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  54.73 
 
 
811 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  61.98 
 
 
1120 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  66.6 
 
 
928 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.93 
 
 
787 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.09 
 
 
769 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  51.99 
 
 
755 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.97 
 
 
1157 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.25 
 
 
1202 aa  635  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  62.43 
 
 
1310 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  61.58 
 
 
1014 aa  631  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  64.94 
 
 
1342 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.94 
 
 
1329 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.43 
 
 
1310 aa  628  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  64.94 
 
 
1310 aa  625  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.43 
 
 
784 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  64.94 
 
 
1369 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  64.94 
 
 
1329 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>