More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1285 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  51.75 
 
 
769 aa  727    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
799 aa  1612    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.27 
 
 
834 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.04 
 
 
1527 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.56 
 
 
781 aa  891    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.05 
 
 
807 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  62.94 
 
 
781 aa  882    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  69.06 
 
 
959 aa  675    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.56 
 
 
786 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  75.81 
 
 
779 aa  1157    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  42.89 
 
 
879 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  63.02 
 
 
822 aa  908    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.02 
 
 
818 aa  1078    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.04 
 
 
1527 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  49.69 
 
 
786 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  47.94 
 
 
801 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.04 
 
 
1610 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  72.65 
 
 
777 aa  1090    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  72.02 
 
 
1725 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  72.02 
 
 
1725 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  63.02 
 
 
822 aa  908    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  46.5 
 
 
794 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  46.52 
 
 
794 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  48.18 
 
 
801 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  49.05 
 
 
784 aa  669    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  56.12 
 
 
768 aa  759    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  69.33 
 
 
1107 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  63.32 
 
 
774 aa  901    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  58.7 
 
 
757 aa  777    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.22 
 
 
819 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  72.02 
 
 
1851 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  63.02 
 
 
822 aa  908    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  47.81 
 
 
814 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  47.83 
 
 
802 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.45 
 
 
1707 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  46.33 
 
 
778 aa  643    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  62.55 
 
 
769 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  72.24 
 
 
1673 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.08 
 
 
1485 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  72.02 
 
 
1834 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.42 
 
 
821 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  66.79 
 
 
777 aa  1007    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.65 
 
 
770 aa  806    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  63.02 
 
 
768 aa  911    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  56.31 
 
 
776 aa  792    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0756  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.73 
 
 
803 aa  916    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0143018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.22 
 
 
763 aa  790    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.93 
 
 
784 aa  668    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  72.22 
 
 
1784 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  62.64 
 
 
819 aa  905    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.14 
 
 
831 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  63.02 
 
 
822 aa  907    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  72.02 
 
 
1851 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  63.02 
 
 
768 aa  911    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.03 
 
 
769 aa  894    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.9 
 
 
784 aa  1144    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  48.71 
 
 
782 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  47.3 
 
 
804 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  59.31 
 
 
765 aa  800    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  74.54 
 
 
781 aa  1142    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  70.88 
 
 
1430 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  62.01 
 
 
771 aa  903    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  66.25 
 
 
1369 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.3 
 
 
786 aa  703    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  49.69 
 
 
786 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  62.58 
 
 
755 aa  908    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  58.97 
 
 
770 aa  820    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  63.19 
 
 
775 aa  902    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  70.29 
 
 
1123 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.76 
 
 
787 aa  1088    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  72.02 
 
 
1725 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.03 
 
 
908 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.53 
 
 
779 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.25 
 
 
769 aa  894    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.04 
 
 
1527 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.6 
 
 
837 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  48.51 
 
 
802 aa  670    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.5 
 
 
769 aa  897    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  74.66 
 
 
776 aa  1149    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.82 
 
 
781 aa  897    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.03 
 
 
908 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.66 
 
 
776 aa  1148    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  51.88 
 
 
789 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.95 
 
 
789 aa  709    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  46.33 
 
 
778 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.45 
 
 
769 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.84 
 
 
1640 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  47.43 
 
 
811 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.59 
 
 
770 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  63.02 
 
 
768 aa  911    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  72.02 
 
 
1725 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.25 
 
 
769 aa  894    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.9 
 
 
850 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  60.67 
 
 
973 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  47.61 
 
 
844 aa  622  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.85 
 
 
1157 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.39 
 
 
849 aa  618  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.03 
 
 
733 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.51 
 
 
841 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  46 
 
 
837 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>