More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5762 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  84.65 
 
 
404 aa  653  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  781  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  79.95 
 
 
405 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  79.95 
 
 
405 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  80.05 
 
 
405 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  80.05 
 
 
405 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  79.7 
 
 
405 aa  605  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  80.4 
 
 
405 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  83.57 
 
 
388 aa  573  1e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  71.8 
 
 
400 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  71.8 
 
 
400 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  71.54 
 
 
400 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  66.93 
 
 
395 aa  492  1e-138  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  68.1 
 
 
398 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  68.36 
 
 
398 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  61.32 
 
 
400 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  61.4 
 
 
399 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  58.81 
 
 
401 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  59.85 
 
 
399 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  62.57 
 
 
399 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  61.42 
 
 
399 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  51.19 
 
 
393 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  62.83 
 
 
402 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  51.1 
 
 
401 aa  321  2e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  49.87 
 
 
398 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  47.7 
 
 
396 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  45.27 
 
 
389 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  45.27 
 
 
389 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  44.5 
 
 
407 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
402 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  46.15 
 
 
406 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.92 
 
 
402 aa  286  6e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.09 
 
 
413 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  49.47 
 
 
408 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.41 
 
 
416 aa  262  7e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  41.58 
 
 
405 aa  254  2e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 
413 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.84 
 
 
399 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.58 
 
 
399 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
447 aa  249  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  49.75 
 
 
409 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.14 
 
 
399 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  36.17 
 
 
392 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.26 
 
 
385 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.46 
 
 
399 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  34.95 
 
 
406 aa  234  1e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  34.95 
 
 
406 aa  234  1e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  34.95 
 
 
403 aa  233  4e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  39.69 
 
 
399 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  39.69 
 
 
399 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  39.69 
 
 
399 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.4 
 
 
394 aa  229  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  39.75 
 
 
405 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.25 
 
 
395 aa  222  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  41.03 
 
 
433 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.47 
 
 
394 aa  221  2e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.27 
 
 
403 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
397 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
413 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  40.11 
 
 
391 aa  217  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
406 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
406 aa  216  6e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  39.43 
 
 
425 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  42.11 
 
 
422 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  41.41 
 
 
431 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.58 
 
 
394 aa  213  6e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.58 
 
 
394 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.58 
 
 
394 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.58 
 
 
394 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  39.22 
 
 
389 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.14 
 
 
411 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  43.77 
 
 
427 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.78785e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  43.77 
 
 
427 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.69 
 
 
383 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  40.58 
 
 
394 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  42.67 
 
 
427 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
394 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
399 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  43.47 
 
 
427 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
391 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
387 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  41.84 
 
 
399 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.88 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.88 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.21 
 
 
394 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.88 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.88 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.88 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.94 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.88 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.88 
 
 
399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.21 
 
 
394 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
419 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.21 
 
 
394 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.21 
 
 
394 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 
415 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
408 aa  201  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  37.53 
 
 
426 aa  202  1e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
413 aa  201  2e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
394 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>