233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5554 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
451 aa  885  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  61.26 
 
 
453 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  61.31 
 
 
453 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  60.49 
 
 
452 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  62.5 
 
 
455 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  62.68 
 
 
444 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  52.16 
 
 
452 aa  418  1e-115  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  53.17 
 
 
423 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  46.99 
 
 
475 aa  358  1e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  43.54 
 
 
450 aa  319  8e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  41.44 
 
 
455 aa  313  3e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3129  Na+/H+ antiporter NhaA  52.04 
 
 
422 aa  312  6e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3856  Na+/H+ antiporter NhaA  52.28 
 
 
416 aa  307  2e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  41.76 
 
 
455 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  43.54 
 
 
456 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  42.19 
 
 
468 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  43.3 
 
 
449 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  42.01 
 
 
472 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  38.46 
 
 
446 aa  294  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  44.98 
 
 
445 aa  293  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  42.32 
 
 
402 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.34714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
390 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  45.22 
 
 
457 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.57 
 
 
391 aa  289  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  36.05 
 
 
435 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.71 
 
 
391 aa  286  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.8 
 
 
409 aa  283  6e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  36.73 
 
 
438 aa  282  7e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  9.33832e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.57 
 
 
394 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  39.16 
 
 
396 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  39.58 
 
 
451 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.15 
 
 
394 aa  279  9e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  41.31 
 
 
446 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  39.58 
 
 
436 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  38.28 
 
 
444 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  41.96 
 
 
438 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  42.44 
 
 
460 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.15 
 
 
397 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  36.88 
 
 
427 aa  276  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  39.22 
 
 
514 aa  276  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.67 
 
 
394 aa  275  1e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.17181e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  41.11 
 
 
465 aa  275  1e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.48 
 
 
391 aa  275  1e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  274  2e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  274  2e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.89 
 
 
391 aa  274  2e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.44 
 
 
394 aa  274  2e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  274  2e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  37.87 
 
 
424 aa  274  2e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  274  2e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  274  2e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.76 
 
 
404 aa  273  4e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.14 
 
 
397 aa  273  4e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.95 
 
 
382 aa  272  8e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.39 
 
 
389 aa  272  8e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 
398 aa  272  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  39.2 
 
 
464 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 
406 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.39 
 
 
389 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.39 
 
 
389 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.39 
 
 
394 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.29218e-06  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.15 
 
 
389 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.91 
 
 
392 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.09 
 
 
397 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.1 
 
 
389 aa  270  3e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  40.77 
 
 
470 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.27 
 
 
395 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.93238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
388 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  40.46 
 
 
388 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.18 
 
 
395 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.35 
 
 
391 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  40.52 
 
 
408 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  43.67 
 
 
426 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.54 
 
 
398 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.77 
 
 
389 aa  263  5e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.74 
 
 
400 aa  263  5e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.63 
 
 
389 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.63 
 
 
389 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  37.47 
 
 
396 aa  262  8e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.89 
 
 
421 aa  262  9e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.02 
 
 
398 aa  262  9e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  37.88 
 
 
401 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.8 
 
 
391 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  38.98 
 
 
612 aa  260  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.32 
 
 
383 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  39.81 
 
 
624 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1101  Na+/H+ antiporter NhaA  38.44 
 
 
458 aa  256  6e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  42.65 
 
 
481 aa  256  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  38.19 
 
 
425 aa  255  1e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  39 
 
 
382 aa  254  2e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  43.18 
 
 
424 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  35.84 
 
 
382 aa  253  4e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  37.68 
 
 
379 aa  253  4e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>