More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4619 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  79.85 
 
 		 564 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  87.67 
 
 		 501 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  61.91 
 
 		 506 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  79.85 
 
 		 561 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 506 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  79.85 
 
 		 546 aa  801    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  62.21 
 
 		 509 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  79.85 
 
 		 564 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 506 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  61.91 
 
 		 506 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  79.85 
 
 		 564 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  79.85 
 
 		 564 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.78 
 
 		 515 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  80.7 
 
 		 503 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  75.34 
 
 		 523 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  61.23 
 
 		 507 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 506 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  80.7 
 
 		 502 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  81.29 
 
 		 503 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 506 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  80.54 
 
 		 562 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  86.92 
 
 		 501 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 513 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  60.93 
 
 		 507 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  80.7 
 
 		 502 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  61.35 
 
 		 511 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  61.51 
 
 		 507 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 507 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  81.09 
 
 		 502 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  80.9 
 
 		 502 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  100 
 
 		 520 aa  1052    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  61.51 
 
 		 507 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  61.51 
 
 		 507 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  80.7 
 
 		 502 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  61.75 
 
 		 521 aa  628  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  57.17 
 
 		 509 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  56.2 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.43 
 
 		 507 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.53 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  46.04 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.09 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.64 
 
 		 497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  47.45 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 501 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  45.98 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  46.95 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.99 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.17 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  41.2 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 501 aa  353  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 492 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.34 
 
 		 507 aa  346  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 511 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 498 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 488 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  39.72 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.12 
 
 		 489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  42.37 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.96 
 
 		 491 aa  323  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 495 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.6 
 
 		 494 aa  313  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  39.08 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 487 aa  300  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 506 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 		 520 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 470 aa  299  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 475 aa  297  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.24 
 
 		 514 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 508 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 490 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 477 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.84 
 
 		 523 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36.91 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.33 
 
 		 495 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 515 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>