227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1823 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1823  cobalamin biosynthesis protein CbiB  100 
 
 		 325 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.8692500000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1286  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.45 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.726575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  30.48 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  30.16 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1110  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.13 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1305  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.13 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3553  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.21 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0341108  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2210  cobalamin biosynthesis protein  25.79 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2369  cobalamin biosynthesis protein  25.79 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3150  adenosylcobinamide-phosphate synthase  31.45 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000125584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.84 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2256  cobalamin biosynthesis protein  26.21 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2203  cobalamin biosynthesis protein  25.79 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0301  cobalamin biosynthesis protein CobD  27.07 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  24.24 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2156  cobalamin biosynthesis protein  25.79 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1019  cobalamin biosynthesis protein CobD  30.26 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1931  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.75 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29.27 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0486  adenosylcobinamide-phosphate synthase  23.69 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1468  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.65 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3604  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.5 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2990  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.13 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1738  cobalamin biosynthesis protein CobD  25 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  27.69 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3538  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.67 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0940  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.63 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0042  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.15 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0483  cobalamin biosynthesis protein  20.88 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2704  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.67 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  25.46 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21170  cobalamin biosynthesis protein CobD  21.82 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  26.39 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  24.42 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  26.39 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  26.39 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  23.96 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  24.07 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  25.33 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  24.07 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  23.96 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  23.96 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  23.96 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  23.96 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1099  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.29 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  25.46 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  25.46 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  25.46 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0870  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.25 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_592  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.18 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0654  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.18 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0688  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.18 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  25 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  24.71 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3092  cobalamin biosynthesis protein CobD  23 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.423715  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  25.23 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  23.18 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  23.61 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3929  cobalamin biosynthesis protein  21.81 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  24.62 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  23.58 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  22.73 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0624  adenosylcobinamide-phosphate synthase  24.91 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  22.27 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  24.62 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.55 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  23.89 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0633  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.52 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0420011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0561  cobalamin biosynthesis protein CobD  22 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.74 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1068  cobalamin biosynthesis protein  22.9 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  25.09 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  25.09 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  23.4 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4469  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.15 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.0655318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  21.8 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1287  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.86 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0123328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  21.77 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0555  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.33 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3443  cobalamin biosynthesis protein CobD  21.55 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  26.2 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  21.88 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  22.82 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  27.14 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3555  cobalamin biosynthesis protein  20.16 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  21.67 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1267  cobalamin biosynthesis protein  22.56 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  21.2 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  23.44 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6127  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.77 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00302618  hitchhiker  0.00095084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0388  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.71 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1119  cobalamin biosynthesis protein  20.75 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0790  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.01 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0828155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2741  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.2 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0757  cobalamin biosynthesis protein  21.43 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.463156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  21.34 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1514  cobalamin biosynthesis protein  25.11 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  22.41 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1266  cobalamin biosynthesis protein  21.28 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3273  cobalamin biosynthesis protein CobD  22.99 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>