More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3463 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3119  porin  94.22 
 
 
421 aa  757    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  92.7 
 
 
397 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  94.71 
 
 
397 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  93.95 
 
 
397 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  100 
 
 
445 aa  892    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  94.22 
 
 
421 aa  757    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  92.95 
 
 
397 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  79.6 
 
 
397 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  50 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  50 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  50 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  50 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  50 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  50.51 
 
 
391 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  46.37 
 
 
386 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  46.37 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  46.37 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  47.07 
 
 
390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  45.61 
 
 
386 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  48.01 
 
 
390 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.34 
 
 
436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  48.01 
 
 
390 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  45.86 
 
 
386 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  46.68 
 
 
386 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.85 
 
 
436 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  47.48 
 
 
390 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  46.31 
 
 
390 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.91 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.91 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.91 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.91 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.91 
 
 
386 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  46.95 
 
 
390 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  46.54 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  46.54 
 
 
411 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  46.54 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  44.53 
 
 
393 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  46.54 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  46.95 
 
 
386 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  47.11 
 
 
390 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.17 
 
 
386 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  44.39 
 
 
387 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  44.94 
 
 
393 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.89 
 
 
385 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  43.87 
 
 
394 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  46.28 
 
 
430 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  46.28 
 
 
430 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.28 
 
 
383 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.28 
 
 
383 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.89 
 
 
385 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.28 
 
 
383 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  46.28 
 
 
384 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  46.45 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  46.74 
 
 
400 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  46.74 
 
 
400 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  46.74 
 
 
400 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  45.6 
 
 
405 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  46.19 
 
 
430 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  46.19 
 
 
430 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  46.74 
 
 
400 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  42.97 
 
 
390 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.63 
 
 
389 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  45.6 
 
 
405 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  45.94 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  45.94 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  45.94 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  45.94 
 
 
390 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  45.08 
 
 
399 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  46.21 
 
 
400 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  45.08 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  45.38 
 
 
523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.3 
 
 
383 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  43.61 
 
 
389 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  44.67 
 
 
406 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  44.67 
 
 
406 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  44.67 
 
 
406 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.19 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  44.73 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  43.75 
 
 
402 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  42.39 
 
 
411 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  45.19 
 
 
403 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  44.3 
 
 
385 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  48.82 
 
 
292 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  44.03 
 
 
385 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  45.62 
 
 
385 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  45.62 
 
 
385 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  43.85 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  45.36 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.29 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.75 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  43.05 
 
 
386 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  44.22 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  42.49 
 
 
386 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.29 
 
 
402 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  44.3 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  43.64 
 
 
405 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  42.97 
 
 
404 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  41.69 
 
 
405 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  42.26 
 
 
399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  43.04 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>