More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1937 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  90.93 
 
 
386 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  90.16 
 
 
386 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  90.93 
 
 
386 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  90.16 
 
 
386 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  90.67 
 
 
386 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  100 
 
 
386 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  90.67 
 
 
386 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  76.03 
 
 
388 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  68.51 
 
 
384 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  68.51 
 
 
430 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  65.32 
 
 
394 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  68.51 
 
 
411 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  68.21 
 
 
385 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  68.51 
 
 
430 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  68.51 
 
 
384 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  67.3 
 
 
523 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  68.51 
 
 
384 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  68.51 
 
 
384 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  67.21 
 
 
385 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  67.93 
 
 
385 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  67.93 
 
 
385 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  65.11 
 
 
386 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  67.66 
 
 
385 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  66.4 
 
 
385 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  61.88 
 
 
386 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  63.64 
 
 
386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  63.12 
 
 
386 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  60.97 
 
 
387 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  61.71 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  62.81 
 
 
393 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  63.66 
 
 
386 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  63.49 
 
 
386 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  63.66 
 
 
386 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  57.97 
 
 
390 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  57.65 
 
 
390 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  59.3 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  57.65 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  58.7 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  57.51 
 
 
430 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  59.07 
 
 
404 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  58.97 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  58.97 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  58.97 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  57.25 
 
 
390 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  57.25 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  57.51 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  57.51 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  57.25 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  57.25 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  56.33 
 
 
376 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  56.33 
 
 
376 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  56.33 
 
 
376 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  52.23 
 
 
389 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  54.26 
 
 
376 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.67 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.31 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  46.43 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  46.43 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  46.68 
 
 
397 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.66 
 
 
385 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.66 
 
 
385 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.92 
 
 
397 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.8 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.29 
 
 
436 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.95 
 
 
445 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.29 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.29 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.29 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.29 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.29 
 
 
386 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.23 
 
 
389 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.04 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.11 
 
 
397 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.64 
 
 
383 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.64 
 
 
383 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.64 
 
 
383 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.61 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.39 
 
 
383 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.14 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.97 
 
 
389 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.97 
 
 
389 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  44.04 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.28 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.86 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  44 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  44.04 
 
 
400 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  46.43 
 
 
381 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.42 
 
 
391 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  44.65 
 
 
403 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  43.28 
 
 
380 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  39.17 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.99 
 
 
402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  40.1 
 
 
394 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  41.4 
 
 
395 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  42.25 
 
 
395 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  42.25 
 
 
395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>