68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1991 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
375 aa  772  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  67.65 
 
 
377 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  65.15 
 
 
374 aa  511  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
398 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 
411 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
377 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.13 
 
 
391 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  23.87 
 
 
373 aa  85.5  1e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
395 aa  84.7  3e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
394 aa  84  4e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
379 aa  83.2  7e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.62 
 
 
385 aa  82.4  1e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
381 aa  78.2  2e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
380 aa  77.4  4e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
385 aa  77  5e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
385 aa  73.9  4e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  20.78 
 
 
362 aa  72.4  1e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  20.78 
 
 
362 aa  72  1e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  20.78 
 
 
362 aa  72.4  1e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  21.99 
 
 
377 aa  70.5  4e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
379 aa  70.1  6e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.81 
 
 
392 aa  67.8  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  21.01 
 
 
397 aa  65.9  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  26.85 
 
 
381 aa  65.5  1e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.14 
 
 
369 aa  64.7  2e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  25.67 
 
 
367 aa  64.7  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  23.79 
 
 
395 aa  63.9  4e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  25.68 
 
 
378 aa  63.2  6e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  23.59 
 
 
402 aa  63.2  7e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 
370 aa  63.2  8e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  22.59 
 
 
367 aa  62.8  9e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  25.27 
 
 
387 aa  62.4  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  26.17 
 
 
394 aa  61.2  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  28.11 
 
 
385 aa  60.1  7e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  22.73 
 
 
374 aa  59.7  8e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  23.18 
 
 
367 aa  58.9  1e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  21.89 
 
 
405 aa  58.9  1e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 
392 aa  56.6  6e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  23.04 
 
 
380 aa  55.8  1e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.69 
 
 
377 aa  55.1  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
363 aa  55.1  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  26.53 
 
 
393 aa  54.7  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  18.94 
 
 
370 aa  53.5  6e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  23.58 
 
 
368 aa  52.8  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  28.29 
 
 
369 aa  52.4  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  20.57 
 
 
388 aa  50.8  4e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  21.64 
 
 
369 aa  50.8  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
381 aa  50.1  7e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  21.37 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
462 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  22.88 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  22.75 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  22.75 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
222 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  23.53 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  23.53 
 
 
386 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
416 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  21.24 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  22.22 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0748  transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 
176 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  22.28 
 
 
350 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 
247 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0747  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 
176 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>