More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 
495 aa  983    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  60.94 
 
 
489 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  52.97 
 
 
498 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  54.58 
 
 
501 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  52.11 
 
 
498 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  50.81 
 
 
506 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  46.89 
 
 
505 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  48.12 
 
 
510 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  49.28 
 
 
493 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  49.28 
 
 
493 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  49.08 
 
 
493 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  48.5 
 
 
505 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  43.29 
 
 
495 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  43.85 
 
 
503 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.26 
 
 
500 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  31.4 
 
 
512 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  30 
 
 
506 aa  239  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  36.35 
 
 
548 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.49 
 
 
511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.46 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  33.67 
 
 
493 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  30.26 
 
 
506 aa  231  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  34.28 
 
 
501 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  29.47 
 
 
506 aa  229  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.74 
 
 
512 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.13 
 
 
498 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
505 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.21 
 
 
492 aa  223  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.21 
 
 
492 aa  223  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.63 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.86 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.89 
 
 
509 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.6 
 
 
538 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  34.82 
 
 
494 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  34.82 
 
 
494 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.5 
 
 
497 aa  216  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  33.01 
 
 
508 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  34.41 
 
 
494 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.27 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.17 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.78 
 
 
512 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.74 
 
 
488 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 
503 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.6 
 
 
490 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  33.33 
 
 
512 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.92 
 
 
499 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  30.1 
 
 
499 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  30.59 
 
 
514 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.18 
 
 
502 aa  200  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.81 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.94 
 
 
499 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.55 
 
 
511 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  31.57 
 
 
510 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.9 
 
 
511 aa  196  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.02 
 
 
504 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.17 
 
 
517 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.23 
 
 
515 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.17 
 
 
517 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  31.17 
 
 
484 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.61 
 
 
514 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.6 
 
 
509 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.98 
 
 
506 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.86 
 
 
489 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  34.55 
 
 
481 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.97 
 
 
484 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  30.77 
 
 
484 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  31.04 
 
 
515 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  31.13 
 
 
515 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  31.13 
 
 
515 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  31.13 
 
 
515 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.37 
 
 
515 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  32.32 
 
 
481 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  29.96 
 
 
484 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  30.98 
 
 
515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.6 
 
 
505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.35 
 
 
500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  29.37 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  30.62 
 
 
513 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  32.45 
 
 
485 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  30.62 
 
 
502 aa  183  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  30.89 
 
 
486 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 
524 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  29.55 
 
 
484 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  30 
 
 
484 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  29.55 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  31.01 
 
 
492 aa  179  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.75 
 
 
472 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  29.32 
 
 
484 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.74 
 
 
503 aa  177  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  29.51 
 
 
514 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  29.32 
 
 
484 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  29.32 
 
 
484 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  29.32 
 
 
484 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  29.29 
 
 
484 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>