More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  872    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  42.34 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  41.89 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.38 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  45 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  40.3 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  44.36 
 
 		 397 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  45.02 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  42.75 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  38.98 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  37.28 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  42.16 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.58 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.71 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.6 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  42.75 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  39.25 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.35 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  47.17 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33.76 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  42.78 
 
 		 408 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.68 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.69 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  39.91 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  43.15 
 
 		 385 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.87 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.37 
 
 		 384 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  38.26 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 420 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.2 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.24 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  42.8 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.88 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.49 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  42.34 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  41.42 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  44.2 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.93 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 869 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  45.24 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  39.58 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  44.02 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  44.18 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.2 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0240  histidine kinase  42.24 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.58 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  40.44 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.32 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  41.67 
 
 		 357 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  40.34 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  40.27 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.34 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  34.71 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  44.98 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  39.3 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.73 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  39.3 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  35.2 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  40.57 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.76 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.83 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  40 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  37.14 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  40.97 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.78 
 
 		 271 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  40.61 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  44.33 
 
 		 372 aa  136  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  41.71 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2600  histidine kinase  43.18 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.75 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.74 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  30.4 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.15 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  40.76 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>