More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2348 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  100 
 
 
210 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 
225 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  63.73 
 
 
219 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  51.6 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  53.27 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  56 
 
 
216 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  60 
 
 
217 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  57.37 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
208 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
212 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  50 
 
 
208 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 
210 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 
209 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 
209 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
207 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  50 
 
 
211 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  56.71 
 
 
207 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 
207 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  50 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  46.32 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  46.39 
 
 
215 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  52.91 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  47.34 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  41.12 
 
 
207 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
177 aa  118  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
180 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
178 aa  111  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  42.44 
 
 
177 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
178 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
281 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
177 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
179 aa  104  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
176 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
172 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
184 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
180 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.92 
 
 
176 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.18 
 
 
187 aa  99  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
192 aa  99  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
177 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
183 aa  94.7  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  36.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.67 
 
 
196 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  36.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.11 
 
 
196 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.42 
 
 
207 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
200 aa  92  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
196 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  35.68 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.75 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
173 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.75 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
180 aa  88.2  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
175 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
186 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  29.83 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
211 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  40.6 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  26.86 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.21 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.21 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>