260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6043 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 414 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  97.1 
 
 		 414 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  50.12 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  49.16 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  48.92 
 
 		 410 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  48.92 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  47.39 
 
 		 406 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  47.39 
 
 		 406 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  41.5 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  41.75 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  41.5 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  41.27 
 
 		 444 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  34.65 
 
 		 767 aa  223  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  36.56 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  35.07 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  35.07 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 756 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 715 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 715 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.37 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 747 aa  199  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.93 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 723 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  34.32 
 
 		 715 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  32.26 
 
 		 764 aa  186  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  32.7 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 775 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  36.62 
 
 		 703 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  33.66 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 689 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  36.06 
 
 		 683 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 452 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  29.3 
 
 		 816 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  34.66 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  30.05 
 
 		 883 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  29.46 
 
 		 951 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 750 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 749 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 		 573 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 		 748 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  25.42 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.46 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.46 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.54 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.54 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 		 592 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.54 
 
 		 625 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.68 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.69 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.43 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  23.69 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.85 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.94 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.94 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.61 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.61 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.37 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.43 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.61 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.43 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.69 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.69 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.69 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.69 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.69 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.88 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  23.06 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  23.44 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  23.44 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.44 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.66 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>