More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3707 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.76 
 
 
479 aa  858  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
482 aa  978  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.05 
 
 
485 aa  830  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.25 
 
 
494 aa  860  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.55 
 
 
482 aa  965  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.04 
 
 
494 aa  858  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.25 
 
 
494 aa  860  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  56.2 
 
 
484 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 
485 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
484 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  44.8 
 
 
481 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 
458 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  43.46 
 
 
473 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.35 
 
 
454 aa  338  1e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 
465 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  42.98 
 
 
454 aa  329  5e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  42.01 
 
 
454 aa  327  4e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
470 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  38.46 
 
 
461 aa  282  9e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.21939e-06  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
461 aa  282  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  38.24 
 
 
461 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.57758e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
444 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
467 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.12 
 
 
466 aa  219  8e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
480 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
467 aa  217  3e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
472 aa  214  3e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
469 aa  213  6e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
464 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
463 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
480 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
475 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
462 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.75 
 
 
463 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
462 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
462 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
469 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
469 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
445 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  44.08 
 
 
445 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  40.57 
 
 
453 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
465 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
465 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
450 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
469 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  31.57 
 
 
463 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
474 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
464 aa  202  1e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
489 aa  201  2e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
461 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
465 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
458 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
466 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
457 aa  198  1e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
458 aa  198  1e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  38.81 
 
 
482 aa  197  2e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
445 aa  198  2e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  32.37 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
468 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
471 aa  197  4e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
450 aa  197  4e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
471 aa  197  5e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  38.95 
 
 
480 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
469 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  32.48 
 
 
467 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  28.82 
 
 
464 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
480 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
468 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
468 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
449 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.28 
 
 
446 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
468 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1074  Signal transduction histidine kinase  68.97 
 
 
273 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  32.62 
 
 
468 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2304  two-component sensor  68.97 
 
 
280 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
467 aa  193  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  34.12 
 
 
470 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  38.25 
 
 
482 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.55 
 
 
468 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  38.25 
 
 
482 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  37.84 
 
 
431 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
465 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  38.25 
 
 
482 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  38.25 
 
 
475 aa  191  3e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  38.25 
 
 
482 aa  191  3e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.67 
 
 
462 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
467 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0990  heavy metal sensor kinase  64.79 
 
 
161 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
461 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  32.9 
 
 
443 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  34.8 
 
 
459 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  36.18 
 
 
491 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  36.18 
 
 
491 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
473 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  27.88 
 
 
464 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  36.18 
 
 
491 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  32.15 
 
 
483 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
489 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  27.88 
 
 
464 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  27.88 
 
 
464 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>