193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3514 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
697 aa  1454  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  97.13 
 
 
697 aa  1422  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  84.51 
 
 
695 aa  1245  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  53.45 
 
 
724 aa  781  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  91.68 
 
 
697 aa  1354  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  55.28 
 
 
712 aa  779  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  91.68 
 
 
697 aa  1354  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  55.28 
 
 
712 aa  779  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  91.68 
 
 
697 aa  1354  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  91.54 
 
 
698 aa  1356  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  46.14 
 
 
665 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  45.21 
 
 
671 aa  512  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  44.14 
 
 
671 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  42.35 
 
 
673 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  42.35 
 
 
673 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  42.35 
 
 
673 aa  500  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  40.43 
 
 
640 aa  492  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 
659 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  39.72 
 
 
672 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 
660 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  39.57 
 
 
672 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  39.57 
 
 
672 aa  482  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0269291 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 
672 aa  482  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  39.57 
 
 
672 aa  482  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  39.57 
 
 
672 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  39.42 
 
 
672 aa  482  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 
659 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  41.16 
 
 
628 aa  467  1e-130  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  39.49 
 
 
624 aa  454  1e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 
673 aa  449  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  38.95 
 
 
684 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
373 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
296 aa  100  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
319 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.9 
 
 
273 aa  88.2  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.9 
 
 
273 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.9 
 
 
273 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.9 
 
 
273 aa  86.7  1e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
548 aa  82.4  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
548 aa  82  3e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 
273 aa  80.9  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 
273 aa  80.9  7e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 
256 aa  80.1  1e-13  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 
278 aa  79  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  26.47 
 
 
256 aa  78.6  4e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  25.3 
 
 
273 aa  78.6  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 
371 aa  78.2  5e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  25.3 
 
 
273 aa  77.4  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 
278 aa  77  1e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.55 
 
 
258 aa  77  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  25 
 
 
373 aa  76.6  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
457 aa  76.3  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  21.5 
 
 
298 aa  75.5  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.51632e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  23.44 
 
 
357 aa  75.1  4e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.36 
 
 
264 aa  72.8  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  6.08973e-10 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 
274 aa  71.2  6e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
321 aa  70.9  7e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 
348 aa  70.5  9e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
615 aa  70.5  9e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
615 aa  70.5  9e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
271 aa  70.5  1e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  23.05 
 
 
290 aa  70.1  1e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  23.05 
 
 
290 aa  70.1  1e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  22.33 
 
 
274 aa  68.2  5e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.69924e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  23.21 
 
 
273 aa  68.2  5e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  22.56 
 
 
348 aa  68.2  5e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
401 aa  67.8  7e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  21.61 
 
 
306 aa  67.4  8e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.69 
 
 
306 aa  67.4  9e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  24.55 
 
 
284 aa  66.6  1e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  28.47 
 
 
366 aa  66.6  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  22.37 
 
 
354 aa  67  1e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  1.12343e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 
284 aa  67  1e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 
285 aa  66.6  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
336 aa  65.9  2e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 
348 aa  65.5  3e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
296 aa  65.1  5e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  23.26 
 
 
348 aa  64.7  5e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  23.64 
 
 
289 aa  64.7  6e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  21.05 
 
 
319 aa  64.3  8e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.57717e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.24 
 
 
237 aa  64.3  8e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 
295 aa  63.5  1e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  2.89703e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  23.27 
 
 
280 aa  63.9  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
510 aa  62.8  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 
276 aa  62.8  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 
347 aa  63.2  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.2436e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 
348 aa  62.4  3e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  23.36 
 
 
348 aa  62  3e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  21.3 
 
 
305 aa  62.4  3e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 
383 aa  61.6  4e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  24.06 
 
 
276 aa  62  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  20.08 
 
 
262 aa  62  4e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  24.79 
 
 
590 aa  62  4e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  20.91 
 
 
256 aa  61.2  6e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  22.41 
 
 
270 aa  61.2  6e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 
348 aa  60.1  1e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
348 aa  60.5  1e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  21.86 
 
 
254 aa  59.7  2e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 
282 aa  60.1  2e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
348 aa  59.3  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>