More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4016 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.39 
 
 
562 aa  1020  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  99.29 
 
 
561 aa  1115  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  97.86 
 
 
561 aa  1101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.57 
 
 
562 aa  1023  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  66.48 
 
 
556 aa  716  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.57 
 
 
562 aa  1023  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.57 
 
 
562 aa  1023  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  81 
 
 
568 aa  927  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.39 
 
 
562 aa  1020  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.39 
 
 
562 aa  1020  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.39 
 
 
562 aa  1020  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  98.4 
 
 
561 aa  1105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  96.62 
 
 
562 aa  1092  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 
562 aa  1147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  82.45 
 
 
578 aa  954  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.94 
 
 
581 aa  920  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  98.22 
 
 
561 aa  1105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  80.54 
 
 
564 aa  925  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  97.86 
 
 
561 aa  1101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  90.57 
 
 
562 aa  1030  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.21 
 
 
545 aa  491  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  66.32 
 
 
297 aa  407  1e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  63.23 
 
 
300 aa  401  1e-110  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  66.2 
 
 
328 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  56.79 
 
 
319 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  42.71 
 
 
290 aa  220  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 
299 aa  216  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.92522e-07 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  37.98 
 
 
433 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.76 
 
 
437 aa  175  2e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 
310 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.62 
 
 
310 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  35.96 
 
 
303 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  35.96 
 
 
303 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  33.79 
 
 
287 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  33.45 
 
 
284 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  33.45 
 
 
284 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  33.45 
 
 
284 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.71 
 
 
278 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  35.4 
 
 
282 aa  134  4e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.31 
 
 
288 aa  129  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  31.39 
 
 
306 aa  127  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.26 
 
 
289 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.908949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  31.56 
 
 
285 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.58 
 
 
292 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  31.69 
 
 
306 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  33.98 
 
 
312 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  31.06 
 
 
289 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  31.21 
 
 
314 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  31.03 
 
 
304 aa  122  2e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  32.64 
 
 
287 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  29.64 
 
 
311 aa  121  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  32.52 
 
 
302 aa  120  5e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.52 
 
 
302 aa  120  5e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.52 
 
 
302 aa  120  5e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  31.94 
 
 
292 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.52 
 
 
302 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.52 
 
 
302 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  31.51 
 
 
302 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  32.08 
 
 
302 aa  119  1e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  31.51 
 
 
302 aa  119  1e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  32.17 
 
 
302 aa  119  1e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.17 
 
 
302 aa  119  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  30.77 
 
 
294 aa  119  1e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  33.47 
 
 
304 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  31.82 
 
 
302 aa  117  4e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  31.8 
 
 
287 aa  117  4e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  30.33 
 
 
310 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  30.58 
 
 
312 aa  116  1e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  30.31 
 
 
305 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  28.42 
 
 
288 aa  113  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  31.79 
 
 
304 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  35.48 
 
 
307 aa  113  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  31.48 
 
 
284 aa  112  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  31.79 
 
 
306 aa  112  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  32.23 
 
 
293 aa  113  1e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.22 
 
 
289 aa  112  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  31.47 
 
 
302 aa  112  2e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
454 aa  112  2e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  30 
 
 
295 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  33.72 
 
 
306 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  27.6 
 
 
274 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  31.34 
 
 
286 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  36.82 
 
 
304 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  29.27 
 
 
312 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.81 
 
 
212 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  30.97 
 
 
325 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  28.19 
 
 
291 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  30.22 
 
 
287 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  28.09 
 
 
289 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  9.79692e-05  hitchhiker  9.49403e-07 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  32.2 
 
 
307 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  29.23 
 
 
308 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  29.27 
 
 
297 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  30.33 
 
 
287 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  31.97 
 
 
301 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  29.27 
 
 
301 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  29.27 
 
 
297 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  29.63 
 
 
295 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  30.31 
 
 
286 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  30.95 
 
 
301 aa  104  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.27671e-07 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  29.46 
 
 
292 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>