More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0684 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  99.5 
 
 
400 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
400 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  100 
 
 
400 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  70.12 
 
 
405 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  71.57 
 
 
405 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  70.77 
 
 
404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  70.41 
 
 
404 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  71.2 
 
 
405 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  71.2 
 
 
405 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  70.94 
 
 
405 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  72.7 
 
 
405 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  64.83 
 
 
395 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  70.99 
 
 
388 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  62.93 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  63.56 
 
 
398 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  59 
 
 
401 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  59.4 
 
 
399 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  59.15 
 
 
399 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  60.57 
 
 
399 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  61.17 
 
 
402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  58.27 
 
 
400 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  58.45 
 
 
399 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  48.44 
 
 
393 aa  349  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  45.81 
 
 
389 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  45.81 
 
 
389 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  47.8 
 
 
401 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  46.65 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  46.92 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  46.48 
 
 
407 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  45.99 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.24 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 
402 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  44.17 
 
 
405 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 
402 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  43.24 
 
 
399 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.97 
 
 
399 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
447 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.01 
 
 
399 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  47.35 
 
 
408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.89 
 
 
394 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.72 
 
 
409 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  43.51 
 
 
399 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.17 
 
 
385 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  36.97 
 
 
406 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  36.97 
 
 
406 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  36.97 
 
 
403 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.84 
 
 
392 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  41.16 
 
 
416 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
413 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
397 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.31 
 
 
395 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.64 
 
 
389 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.59 
 
 
405 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  41.03 
 
 
383 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.89 
 
 
411 aa  223  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.73 
 
 
403 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
415 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  37.76 
 
 
399 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  37.76 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  37.76 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.57 
 
 
415 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  41.69 
 
 
431 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.82 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
413 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.04 
 
 
405 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
387 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
399 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  41.53 
 
 
391 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.84 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.84 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.84 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.84 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  40.84 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 
406 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  41.18 
 
 
405 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.4 
 
 
399 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.86 
 
 
394 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  41.15 
 
 
427 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
413 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.86 
 
 
394 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.86 
 
 
394 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.86 
 
 
394 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.69 
 
 
433 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
399 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  41.55 
 
 
410 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.6 
 
 
407 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.01 
 
 
394 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  38.48 
 
 
402 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 
399 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
406 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  40 
 
 
403 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
389 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.34 
 
 
394 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.6 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  37.99 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  36.54 
 
 
425 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  42.3 
 
 
427 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>