More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2443 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  90.21 
 
 		 516 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  90.54 
 
 		 513 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  71.86 
 
 		 483 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  72.09 
 
 		 485 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  72.52 
 
 		 485 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 544 aa  1060    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  90.54 
 
 		 513 aa  836    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  72.86 
 
 		 486 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  72.22 
 
 		 485 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  90.21 
 
 		 516 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  72.86 
 
 		 486 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  70.44 
 
 		 487 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  56.45 
 
 		 467 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  52.48 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  52.87 
 
 		 462 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  50.1 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  48.02 
 
 		 514 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.51 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.3 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.12 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.98 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.85 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.54 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.23 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.04 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.77 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.55 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  48.55 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.72 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  46.25 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.97 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.6 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.17 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  45.38 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  45.38 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.31 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  44.05 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45 
 
 		 474 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.34 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.64 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.14 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.04 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.58 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.04 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.75 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.09 
 
 		 481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  49.64 
 
 		 491 aa  363  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.13 
 
 		 507 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.36 
 
 		 483 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.84 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.97 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.34 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6206  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.56 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.34 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.56 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.09 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.42 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  43.75 
 
 		 469 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.26 
 
 		 525 aa  360  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.53 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.26 
 
 		 515 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  44.56 
 
 		 486 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.01 
 
 		 489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.4 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.8 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.62 
 
 		 478 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  42.28 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  44.88 
 
 		 474 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  47.98 
 
 		 487 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.89 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  41.15 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  41.27 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.15 
 
 		 477 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.91 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.91 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  45.91 
 
 		 553 aa  349  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.91 
 
 		 512 aa  349  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  45.91 
 
 		 512 aa  349  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  45.91 
 
 		 512 aa  349  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.89 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.15 
 
 		 543 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.26 
 
 		 495 aa  347  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.7 
 
 		 514 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.7 
 
 		 514 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  45.74 
 
 		 514 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  45.74 
 
 		 514 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.74 
 
 		 551 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  45.74 
 
 		 514 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  45.74 
 
 		 512 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.68 
 
 		 484 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.27 
 
 		 492 aa  345  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  41.02 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.62 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  41.02 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  40.74 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  41.2 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  41.2 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>