More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1760 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  89.25 
 
 		 428 aa  796    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  885    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 424 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 421 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  62 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  57.41 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  58.69 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 421 aa  481  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 425 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 424 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 411 aa  312  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 425 aa  296  3e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 427 aa  289  8e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 422 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 431 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 423 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>