254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B1490 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3559  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  5.38882e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3458  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.05772e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3472  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.00846e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3740  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.82671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3722  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.2599e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3812  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  4.46161e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3842  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.57377e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3763  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  6.32531e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3478  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  2.9119e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1490  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.77401e-08  normal  0.0133073 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2390  RNA-binding protein Hfq  97.3 
 
 
74 aa  146  1e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.74663e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1223  RNA-binding protein Hfq  78.38 
 
 
74 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.46944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2103  RNA-binding protein Hfq  77.03 
 
 
75 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1490  RNA chaperone Hfq  67.14 
 
 
86 aa  109  1e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0924374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1694  RNA chaperone Hfq  67.61 
 
 
80 aa  105  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0182098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2729  RNA chaperone Hfq  64.29 
 
 
83 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.94371e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1614  RNA chaperone Hfq  72.46 
 
 
86 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.7462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0774  RNA chaperone Hfq  68.57 
 
 
82 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  9.11615e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1881  RNA chaperone Hfq  63.77 
 
 
80 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.318606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0557  RNA chaperone Hfq  63.77 
 
 
83 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1921  RNA chaperone Hfq  65.22 
 
 
85 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2131  RNA chaperone Hfq  62.32 
 
 
80 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.187321  normal  0.0262415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1116  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 
84 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  5.43156e-15  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11580  RNA chaperone Hfq  56.76 
 
 
76 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0980  hypothetical protein  57.14 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  7.14494e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1497  RNA chaperone Hfq  64.29 
 
 
92 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00847366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1499  RNA-binding protein Hfq  55.71 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.30103e-08 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1174  RNA chaperone Hfq  60 
 
 
80 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1361  RNA chaperone Hfq  60 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000362594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1762  RNA chaperone Hfq  51.43 
 
 
175 aa  81.3  4e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.683558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0395  RNA chaperone Hfq  53.62 
 
 
90 aa  81.3  4e-15  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.48221e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0411  RNA chaperone Hfq  53.62 
 
 
90 aa  80.9  5e-15  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.879276  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1356  RNA-binding protein Hfq  53.03 
 
 
79 aa  81.3  5e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.950341  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0121  RNA chaperone Hfq  52.94 
 
 
88 aa  80.9  6e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000257179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0482  RNA chaperone Hfq  54.69 
 
 
98 aa  80.5  7e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  hitchhiker  0.000910775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2244  RNA-binding protein Hfq  53.03 
 
 
77 aa  80.5  7e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0488883  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1567  RNA-binding protein Hfq  53.03 
 
 
92 aa  80.5  7e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104021  normal  0.0520931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1760  RNA chaperone Hfq  52.11 
 
 
86 aa  80.1  8e-15  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000103863  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4124  RNA-binding protein Hfq  53.03 
 
 
77 aa  79.7  1e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304133  normal  0.524604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1448  RNA-binding protein Hfq  53.03 
 
 
90 aa  79.3  1e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.581854  hitchhiker  0.000378907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2610  RNA-binding protein Hfq  51.52 
 
 
82 aa  79.7  1e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1272  RNA-binding protein Hfq  51.47 
 
 
196 aa  79  2e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1493  RNA-binding protein Hfq  51.52 
 
 
77 aa  79  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.964703  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2843  RNA-binding protein Hfq  51.52 
 
 
77 aa  79  2e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.736896  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1451  RNA-binding protein Hfq  51.52 
 
 
77 aa  79  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4393  RNA chaperone Hfq  51.52 
 
 
106 aa  78.6  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3124  RNA chaperone Hfq  48.57 
 
 
82 aa  78.6  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.344226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0251  RNA-binding protein Hfq  58.33 
 
 
160 aa  78.2  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.069598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1931  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 
193 aa  77.8  4e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2208  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 
78 aa  77.8  5e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1111  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 
78 aa  77.8  5e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4341  host factor Hfq  55.56 
 
 
96 aa  77.8  5e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1070  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 
78 aa  77.8  5e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1613  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
82 aa  76.6  1e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1819  RNA-binding protein Hfq  51.56 
 
 
80 aa  76.3  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798062  normal  0.0504163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2594  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4073  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  76.3  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2867  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.648341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1632  RNA-binding protein Hfq  51.56 
 
 
80 aa  76.3  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614603  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1684  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 
83 aa  76.6  1e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2582  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233324  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2139  RNA chaperone Hfq  51.56 
 
 
109 aa  76.3  1e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3051  RNA chaperone Hfq  50 
 
 
84 aa  75.5  2e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1095  RNA-binding protein Hfq  51.56 
 
 
80 aa  75.9  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455176  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2824  RNA chaperone Hfq  50 
 
 
84 aa  75.5  2e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1493  RNA chaperone Hfq  50 
 
 
83 aa  75.5  2e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2942  RNA chaperone Hfq  50 
 
 
84 aa  75.5  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2878  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  76.3  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2590  host factor Hfq  50 
 
 
90 aa  75.5  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.104665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1449  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  75.9  2e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.083877  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1841  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
82 aa  75.9  2e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1471  RNA-binding protein Hfq  49.3 
 
 
91 aa  75.1  3e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5942  RNA chaperone Hfq  50 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6544  RNA chaperone Hfq  50 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0058  RNA-binding protein Hfq  49.3 
 
 
92 aa  74.7  4e-13  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0070  RNA-binding protein Hfq  49.3 
 
 
92 aa  74.7  4e-13  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0871  host factor-I protein, putative  54.24 
 
 
79 aa  74.7  4e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.942463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0535  RNA chaperone Hfq  48.48 
 
 
83 aa  73.9  7e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2013  RNA chaperone Hfq  45.95 
 
 
92 aa  73.2  1e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0624  RNA-binding protein Hfq  43.66 
 
 
79 aa  72.8  1e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00135703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0447  RNA-binding protein Hfq  51.47 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1525  RNA chaperone Hfq  48.48 
 
 
84 aa  73.6  1e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396727  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4770  RNA-binding protein Hfq  49.28 
 
 
86 aa  72  2e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1884  RNA chaperone Hfq  52.24 
 
 
88 aa  72.4  2e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4894  RNA-binding protein Hfq  49.28 
 
 
86 aa  72  2e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249233  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0277  RNA-binding protein Hfq  48.48 
 
 
85 aa  72.4  2e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0264829  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4946  RNA-binding protein Hfq  47.22 
 
 
86 aa  72  2e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0125907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4685  RNA-binding protein Hfq  49.28 
 
 
86 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1559  RNA chaperone Hfq  52.24 
 
 
88 aa  72.4  2e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192347  unclonable  3.37191e-11 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4730  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4639  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0355  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
103 aa  72  3e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0252672  hitchhiker  0.00389143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5688  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0502195  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3238  RNA chaperone Hfq  47.14 
 
 
77 aa  71.6  3e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4643  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4722  RNA-binding protein Hfq  48.57 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2667  RNA-binding protein Hfq  46.58 
 
 
86 aa  72  3e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1983  hfq protein  45.07 
 
 
82 aa  71.6  3e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.562833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04001  hypothetical protein  48.57 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3653  RNA-binding protein Hfq  47.14 
 
 
101 aa  71.6  3e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.588771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>