More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5006 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  87.17 
 
 		 382 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  86.39 
 
 		 382 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 382 aa  783    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  87.96 
 
 		 382 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  73.97 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  73.71 
 
 		 389 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  74.23 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  72.16 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  73.45 
 
 		 388 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  70.59 
 
 		 391 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  72.58 
 
 		 385 aa  551  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  70.03 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  71.06 
 
 		 387 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  67.35 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  67.77 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  43.73 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  41.73 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  42.78 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  42.66 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.94 
 
 		 380 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  42.29 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  40.26 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  39.73 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  40 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  43.77 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  41.86 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.37 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  42.47 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  39.21 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.08 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  43.22 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  40.43 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.38 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  41.81 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  41.53 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  43.13 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.24 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  40.81 
 
 		 383 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  38.11 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.64 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.97 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.3 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  40.7 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.11 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.41 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  39.84 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.02 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  33.67 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.69 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.69 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.6 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 		 387 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  36.01 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.4 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.4 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.4 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  40.26 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.33 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  35.22 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.48 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  31.75 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.96 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.66 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.22 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.22 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.38 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.82 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.89 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  35.31 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.87 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.75 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.75 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  32.23 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.48 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.2 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.08 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.06 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  32.48 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.14 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.22 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.22 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.22 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.94 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.75 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.01 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.94 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  31.15 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  32.33 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.58 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  33.7 
 
 		 386 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.85 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  32.04 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.62 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  29.43 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.68 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>