More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7174 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7174  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  100 
 
 
314 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.78 
 
 
314 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.54 
 
 
314 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.17 
 
 
311 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0364256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4853  putative ABC transporter (permease protein)  61.15 
 
 
314 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.3 
 
 
315 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.77 
 
 
329 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0558965  normal  0.0907281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.26 
 
 
313 aa  328  9e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05560  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  54.75 
 
 
337 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0332044  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.34 
 
 
318 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.589805  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
315 aa  241  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.77 
 
 
316 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4833  putative ABC transporter (permease protein)  41.45 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3222  ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
338 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0444198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 
319 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
328 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00770957  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.166437  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000398499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
319 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18680  ABC transporter, inner membrane permease component  42.58 
 
 
318 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3089  nickel ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
316 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2959  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.42 
 
 
316 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.14 
 
 
336 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112233  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7203  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.58 
 
 
348 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
319 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
319 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.923467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
332 aa  178  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
316 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
336 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
336 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
336 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353707  normal  0.0409254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  33.22 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  33.22 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  33.93 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.93 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
323 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
309 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.53 
 
 
316 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
314 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
316 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.544656  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
313 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00533013  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
306 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
308 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
312 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1600  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.87 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
321 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
308 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
306 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  35.46 
 
 
309 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.87 
 
 
313 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
316 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04490  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.45 
 
 
318 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
308 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
318 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  31.45 
 
 
316 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
322 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
322 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
322 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
304 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
307 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
321 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
322 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
313 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  33.33 
 
 
313 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
306 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 
309 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
308 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
313 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
320 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
319 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
316 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
306 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2383  dipeptide ABC transporter  38.03 
 
 
323 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
327 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.37 
 
 
330 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
333 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125184  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
321 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
313 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  33.86 
 
 
313 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
334 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
315 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
314 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
320 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>