More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3304 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 333 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7019  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  73.27 
 
 		 333 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.51 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  39.04 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.44 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.99 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  36.87 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.5 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  38.99 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  36.87 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.61 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.31 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  38.39 
 
 		 336 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  38.69 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  38.69 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.58 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.69 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  38.39 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  37.91 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  35.01 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  37.5 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.8 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  35.21 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  37.2 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.12 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  35.52 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  35.99 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  35.29 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  35.29 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.1 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2114  oligopeptide ABC transporter membrane protein  39.57 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.55 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  35.4 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.93 
 
 		 341 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  35.4 
 
 		 339 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  35.21 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  35.59 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  35.59 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  35.59 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  35.8 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  34.81 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  35.59 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  38.64 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1098  peptide ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  35.29 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  35.29 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  35.29 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>