More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0296 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.25 
 
 
338 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0444198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  56.33 
 
 
316 aa  345  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 
328 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00770957  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.4 
 
 
321 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.166437  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3222  ABC transporter, permease protein  49.37 
 
 
316 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
319 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2959  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.89 
 
 
316 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
314 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3089  nickel ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
316 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18680  ABC transporter, inner membrane permease component  46.93 
 
 
318 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.31 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4853  putative ABC transporter (permease protein)  43.55 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.370011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
311 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0364256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
318 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.589805  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
332 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05560  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.49 
 
 
337 aa  221  9e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0332044  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7174  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.37 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
319 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.923467  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353707  normal  0.0409254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7203  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.37 
 
 
348 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0558965  normal  0.0907281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
321 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
315 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
309 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
315 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
321 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 
306 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112233  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
306 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
306 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.13 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000398499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  37.01 
 
 
327 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4833  putative ABC transporter (permease protein)  35.08 
 
 
333 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  37.01 
 
 
310 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  37.34 
 
 
306 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  37.34 
 
 
306 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 
306 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
306 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.01 
 
 
306 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
306 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  35.16 
 
 
307 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  36.36 
 
 
306 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
327 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.69 
 
 
308 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  37.01 
 
 
306 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  37.01 
 
 
306 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  36.36 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 
313 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
316 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
306 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1600  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.29 
 
 
313 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
306 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.04 
 
 
306 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
306 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
306 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
306 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
306 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
312 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.54 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
313 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
313 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
306 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.71 
 
 
306 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
306 aa  188  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  36.25 
 
 
306 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  36.25 
 
 
306 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  35.8 
 
 
327 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
306 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
307 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>