More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3604 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 169 aa  343  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  88.17 
 
 		 169 aa  293  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3217  Holliday junction resolvase  86.98 
 
 		 169 aa  285  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.571528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  91.56 
 
 		 167 aa  275  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  79.04 
 
 		 171 aa  246  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  73.99 
 
 		 173 aa  244  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  77.85 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  73.41 
 
 		 173 aa  241  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  70.89 
 
 		 167 aa  236  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  71.25 
 
 		 175 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  65.68 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  63.69 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0902  Holliday junction resolvase  65.41 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  64.78 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  64.78 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.62 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  65.82 
 
 		 172 aa  187  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.24 
 
 		 175 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  62.87 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  61.08 
 
 		 232 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  63.69 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1289  Holliday junction resolvase  66.26 
 
 		 174 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0930  Holliday junction resolvase  59.64 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.811793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2328  Holliday junction resolvase  63.46 
 
 		 217 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0343755  normal  0.15621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  58.86 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000281167  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0002  Holliday junction resolvase  57.83 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  54.3 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1230  Holliday junction resolvase  62.09 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  57.69 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0964  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  47.8 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  43.56 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 		 161 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  48.68 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  47.17 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2906  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.34 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  51.27 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  47.85 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 284 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 275 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 		 183 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  45.51 
 
 		 180 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 171 aa  140  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  48.41 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  44.37 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  47.47 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  48.7 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  46.84 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  47.74 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 173 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  47.1 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.05 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  44.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  45.81 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>