135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4122 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
393 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  27.57 
 
 
751 aa  86.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  31.1 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  29.15 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.63 
 
 
378 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  26.32 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  33.97 
 
 
741 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  31.58 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  30.8 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  24.17 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  32.5 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  26.16 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  35.06 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  28.57 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  33.14 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  29.08 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  26.1 
 
 
814 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
382 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
903 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  32.37 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
729 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  30.89 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  31.41 
 
 
754 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  25.16 
 
 
375 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  29.23 
 
 
319 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  29.17 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
728 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
728 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  28.74 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.82 
 
 
1119 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  35.51 
 
 
783 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
383 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  26.79 
 
 
1293 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  31.06 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.83 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
477 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  36.52 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.09 
 
 
477 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  36.52 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  36.52 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.05 
 
 
726 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  33.02 
 
 
783 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.96 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.31 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.24 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.31 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
705 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.24 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
390 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
516 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  30.86 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
385 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  22 
 
 
384 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
904 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  25.68 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  40.32 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  27.35 
 
 
861 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  26.99 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0509  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  31.08 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>