More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1811 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1811  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  1034    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00289263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.43 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.14 
 
 		 514 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.79 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.79 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2343  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 518 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288241  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40.55 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.6 
 
 		 513 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 521 aa  356  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  37.88 
 
 		 495 aa  355  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.4 
 
 		 503 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.82 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.72 
 
 		 504 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 499 aa  352  8.999999999999999e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.41 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.45 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.8 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  39.27 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.52 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.52 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  36.73 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  43.15 
 
 		 522 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.53 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.46 
 
 		 506 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.65 
 
 		 861 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.79 
 
 		 519 aa  346  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.06 
 
 		 519 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  41.65 
 
 		 497 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.85 
 
 		 501 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.85 
 
 		 501 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.77 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 517 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39 
 
 		 500 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.97 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  40.49 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.52 
 
 		 517 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.65 
 
 		 499 aa  339  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.4 
 
 		 501 aa  339  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.47 
 
 		 495 aa  339  9e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.04 
 
 		 515 aa  339  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  40.94 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.37 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  37.89 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.95 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  39.47 
 
 		 519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.55 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.92 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  38.94 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  38.94 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  38.94 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  42.71 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  38.58 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.28 
 
 		 517 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.42 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1534  ABC transporter related  41.53 
 
 		 527 aa  336  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0657027  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.33 
 
 		 514 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.33 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.33 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.19 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.57 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.65 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.11 
 
 		 501 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.29 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  38.19 
 
 		 505 aa  335  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.72 
 
 		 501 aa  334  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 505 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  37.63 
 
 		 517 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  40.35 
 
 		 500 aa  332  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.87 
 
 		 508 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  41.06 
 
 		 503 aa  332  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  38.6 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  41.16 
 
 		 508 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  35.12 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  37.9 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  36.47 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.59 
 
 		 496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  38.61 
 
 		 526 aa  329  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 494 aa  329  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.16 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  37.96 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.59 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>