More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2455 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.43 
 
 
928 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  78.89 
 
 
897 aa  1352    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.3 
 
 
891 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  45.15 
 
 
906 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  44.36 
 
 
903 aa  699    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  43.79 
 
 
888 aa  695    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  42.02 
 
 
940 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  40.65 
 
 
922 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  40.99 
 
 
925 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.91 
 
 
915 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  43.57 
 
 
892 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.97 
 
 
892 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  44.8 
 
 
907 aa  683    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.2 
 
 
916 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.74 
 
 
903 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  43.06 
 
 
908 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  40.37 
 
 
921 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  45.05 
 
 
891 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  40.37 
 
 
921 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.35 
 
 
892 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  43.13 
 
 
892 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  78.78 
 
 
897 aa  1352    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.96 
 
 
939 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  41.46 
 
 
930 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  41.78 
 
 
908 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  78.8 
 
 
897 aa  1349    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.04 
 
 
945 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.21 
 
 
926 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  41.1 
 
 
910 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  43.3 
 
 
892 aa  704    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  40.5 
 
 
921 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  42.03 
 
 
939 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 
933 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.33 
 
 
928 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  42.58 
 
 
931 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.75 
 
 
922 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  41.03 
 
 
922 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  41.08 
 
 
922 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.63 
 
 
912 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  41.36 
 
 
918 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  40.37 
 
 
921 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.81 
 
 
918 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  42.73 
 
 
913 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  42.67 
 
 
902 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  40.7 
 
 
911 aa  645    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.92 
 
 
922 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  43.68 
 
 
904 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.1 
 
 
893 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  100 
 
 
899 aa  1778    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.73 
 
 
930 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 
923 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.37 
 
 
935 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  41.8 
 
 
915 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39.74 
 
 
932 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  41.69 
 
 
915 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.59 
 
 
915 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39.74 
 
 
932 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  42.37 
 
 
917 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.85 
 
 
934 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  39.63 
 
 
932 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  40.92 
 
 
957 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  40.95 
 
 
921 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.38 
 
 
930 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.74 
 
 
951 aa  632  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  38.3 
 
 
938 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  41.48 
 
 
895 aa  628  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.15 
 
 
928 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.49 
 
 
934 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  41.31 
 
 
924 aa  628  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.69 
 
 
929 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  42.47 
 
 
943 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.47 
 
 
929 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.88 
 
 
931 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.59 
 
 
905 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.14 
 
 
928 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.63 
 
 
883 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.81 
 
 
928 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  40.63 
 
 
906 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.91 
 
 
928 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.18 
 
 
930 aa  620  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.02 
 
 
928 aa  622  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  39.01 
 
 
934 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.66 
 
 
928 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  37.78 
 
 
936 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  41.18 
 
 
923 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.66 
 
 
928 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  40.88 
 
 
911 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  42.78 
 
 
899 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  42.78 
 
 
899 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  39.72 
 
 
934 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  41.18 
 
 
923 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  39.66 
 
 
928 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.86 
 
 
878 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.44 
 
 
928 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>