More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2011 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  100 
 
 
368 aa  757  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  53.28 
 
 
367 aa  403  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  37.91 
 
 
356 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  39.67 
 
 
378 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  37.3 
 
 
379 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.67 
 
 
373 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.4 
 
 
373 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.86 
 
 
373 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.26 
 
 
371 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.67 
 
 
390 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.51 
 
 
380 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.1 
 
 
389 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  37.84 
 
 
369 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.49 
 
 
403 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  36.96 
 
 
373 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.29 
 
 
391 aa  215  1e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.47 
 
 
379 aa  214  2e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.36 
 
 
390 aa  213  3e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.4 
 
 
433 aa  213  3e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  37.15 
 
 
375 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  35.2 
 
 
388 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  35.75 
 
 
389 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.84 
 
 
380 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.36 
 
 
411 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.52 
 
 
406 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  37.43 
 
 
377 aa  209  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  36.96 
 
 
384 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  38.01 
 
 
382 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  37.16 
 
 
403 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  36.68 
 
 
403 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  37.23 
 
 
395 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.77 
 
 
370 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.78 
 
 
370 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.88 
 
 
390 aa  201  1e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.24 
 
 
373 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  37.08 
 
 
357 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  34.21 
 
 
402 aa  199  8e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  35.89 
 
 
395 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.88 
 
 
391 aa  198  1e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  197  2e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  35.62 
 
 
395 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.05 
 
 
391 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.54 
 
 
379 aa  195  8e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.61 
 
 
391 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.54 
 
 
379 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.09 
 
 
387 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  34.95 
 
 
382 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.42 
 
 
391 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  35.89 
 
 
393 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  35.04 
 
 
386 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  33.6 
 
 
402 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  33.7 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  32.33 
 
 
392 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  36.74 
 
 
358 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  4.16834e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  35.41 
 
 
381 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.5 
 
 
386 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.59 
 
 
369 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.00581e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  34.35 
 
 
378 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.96 
 
 
395 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  35.34 
 
 
395 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  38.67 
 
 
365 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  37.33 
 
 
381 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  34.15 
 
 
376 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.52 
 
 
375 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.68 
 
 
382 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  33.51 
 
 
374 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  33.61 
 
 
380 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  34.56 
 
 
390 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.34 
 
 
380 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  34.74 
 
 
376 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  34.6 
 
 
396 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  31.45 
 
 
399 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  32.25 
 
 
382 aa  185  1e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  32.25 
 
 
382 aa  185  1e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  38.07 
 
 
365 aa  184  2e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  34.48 
 
 
408 aa  184  2e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  31.64 
 
 
399 aa  184  2e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  35.37 
 
 
373 aa  183  4e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  32.5 
 
 
342 aa  183  4e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  32.61 
 
 
399 aa  182  8e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  36.91 
 
 
366 aa  182  9e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  33.88 
 
 
372 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  32.78 
 
 
373 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  36.31 
 
 
397 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  31.59 
 
 
398 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.79 
 
 
408 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  32.08 
 
 
399 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.26 
 
 
358 aa  180  3e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.58 
 
 
395 aa  180  3e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  31.61 
 
 
364 aa  180  3e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  35.04 
 
 
365 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  37.03 
 
 
357 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  36.25 
 
 
410 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  36.21 
 
 
357 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  36.71 
 
 
357 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  34.52 
 
 
365 aa  179  5e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  36.09 
 
 
811 aa  179  5e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>