More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1938 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  41.98 
 
 		 926 aa  732    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 936 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  48.48 
 
 		 939 aa  867    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  45.34 
 
 		 936 aa  846    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  47.17 
 
 		 963 aa  863    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  100 
 
 		 945 aa  1942    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  41.68 
 
 		 950 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.83 
 
 		 891 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.41 
 
 		 945 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  46.02 
 
 		 939 aa  822    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 944 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 956 aa  801    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 943 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  47.21 
 
 		 946 aa  850    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  43.07 
 
 		 924 aa  715    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  44.55 
 
 		 949 aa  802    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  43.44 
 
 		 932 aa  792    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 946 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 893 aa  631  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 891 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 928 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 928 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  40.11 
 
 		 924 aa  629  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 926 aa  625  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 928 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 928 aa  625  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.14 
 
 		 928 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 928 aa  625  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 928 aa  625  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 928 aa  625  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 892 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 892 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 892 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 892 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 988 aa  615  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 930 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 956 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.42 
 
 		 903 aa  612  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 934 aa  612  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 930 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  39.71 
 
 		 924 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 979 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 939 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 932 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 930 aa  605  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.33 
 
 		 893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 934 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 923 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 893 aa  601  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 896 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  40.89 
 
 		 933 aa  602  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 926 aa  602  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.83 
 
 		 951 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 936 aa  598  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 896 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 888 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  40.37 
 
 		 908 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  599  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 911 aa  596  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 936 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 934 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  37.19 
 
 		 1022 aa  593  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 943 aa  595  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 915 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 929 aa  592  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.46 
 
 		 903 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 915 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 928 aa  589  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 992 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 930 aa  592  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 957 aa  589  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 929 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 931 aa  585  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 942 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 915 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 937 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 935 aa  588  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 973 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 937 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 937 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 915 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 922 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  38.11 
 
 		 937 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 921 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 877 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 940 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 978 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 918 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  39.82 
 
 		 913 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>