133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0960 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  49.73 
 
 		 196 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  48.11 
 
 		 1128 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  44.38 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  43.27 
 
 		 185 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  47.8 
 
 		 189 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  47.46 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  41.8 
 
 		 190 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  40.11 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  48 
 
 		 187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  40.61 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  46.99 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  44.94 
 
 		 192 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  45.66 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  40.54 
 
 		 190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  39.33 
 
 		 188 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  41.57 
 
 		 196 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  40.54 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  39.46 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  45.6 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  39.46 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  39.46 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  39.25 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  39.46 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.46 
 
 		 190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  38.92 
 
 		 190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  53.15 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  38.38 
 
 		 191 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  47.77 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.58 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  45.93 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  41.14 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  46.95 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  35.63 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  45.62 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  35.39 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  35.39 
 
 		 183 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  34.76 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  43.33 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  31.28 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.28 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  38.36 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  38.36 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  40.98 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  29.17 
 
 		 428 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  38.46 
 
 		 434 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  40 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0567  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.91 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  26.92 
 
 		 423 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  29.11 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  29.63 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  26.71 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  36.73 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  31.91 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.52 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  38.04 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1255  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.67 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00341421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  41.51 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.14 
 
 		 437 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.11 
 
 		 421 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  40.82 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  29.11 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.85 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.24 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.24 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.85 
 
 		 420 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0374  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>