71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1400 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  71.98 
 
 		 182 aa  286  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  41.9 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  44.44 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  41.3 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  41.3 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  42.08 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  41.85 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  40.86 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  40.86 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  39.78 
 
 		 235 aa  144  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  41.71 
 
 		 183 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  41.71 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  40.34 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  38.5 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  40.7 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  42.31 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  37.43 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  37.43 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  37.43 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  37.43 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  38.46 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  37.43 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  35.48 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  38.76 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  39.23 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  36.36 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  36.26 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  34.95 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  37.22 
 
 		 1128 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  38.65 
 
 		 193 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  44.2 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  36.47 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  35.71 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  33.86 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  35.47 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  32.82 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  34.78 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  33.71 
 
 		 225 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  32.67 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  27.22 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  28.66 
 
 		 475 aa  57.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  30.43 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  26.98 
 
 		 261 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  27.13 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  27.03 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  25.81 
 
 		 261 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  25.81 
 
 		 261 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  25.81 
 
 		 261 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  33.9 
 
 		 447 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  25.6 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  38.33 
 
 		 459 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 		 421 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  36.36 
 
 		 421 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 451 aa  41.2  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 		 421 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 		 419 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  36.36 
 
 		 419 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>