48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0213 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  38.2 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  37.77 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  36.17 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  36.17 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  41.36 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  36.17 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  35.64 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  38.29 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  37.28 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  35.98 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  35.39 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  34.34 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  33.94 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  34.34 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  35.98 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  32.94 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  37.42 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  33.16 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  32.94 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  33.95 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  32.57 
 
 		 195 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  30.99 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  37.65 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  29.27 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  30.18 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  30.34 
 
 		 232 aa  92  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  31.71 
 
 		 1128 aa  90.9  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  29.88 
 
 		 195 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  34.76 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  34.41 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  30 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  33.33 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  34.51 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  31.29 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  29.55 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  28.75 
 
 		 475 aa  54.7  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2748  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.16 
 
 		 298 aa  40.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>