138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1022 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  58.7 
 
 		 1128 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  62.09 
 
 		 189 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  54.05 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  54.26 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  48.63 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  46.7 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  46.99 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  46.49 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  47.85 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  38.59 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  43.78 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  41.85 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  43.45 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  54.23 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  46.63 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  47.46 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  41.08 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  42.6 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  38.25 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  40.76 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  36.79 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  40.11 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  39.55 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  38.98 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.57 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  38.98 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  46.15 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  45.81 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  35.39 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  35.39 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  41.04 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  36.75 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  41.75 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  35.8 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  35.8 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  31.52 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  29.27 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  40.35 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  33.33 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  31.62 
 
 		 693 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 145 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  32.56 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  31.21 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.76 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  40.98 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.94 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32.23 
 
 		 355 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  30.3 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6795  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  33.75 
 
 		 390 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.794475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  42.65 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 409 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.27 
 
 		 356 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  33.87 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.71 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.17 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1310  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.98 
 
 		 419 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.56 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.47 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.56 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  33.62 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  30.22 
 
 		 447 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.17 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.31 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  34.78 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  34.38 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.69 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  25 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.87 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.23 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>