92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1082 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  46.11 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  45.86 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  44.63 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  46.7 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  45.45 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  48.33 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  45.6 
 
 		 1128 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  44.44 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  42.22 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  45.51 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  45.05 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  45.3 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  43.17 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  40.66 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  40.66 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  40.66 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  40.66 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  41.21 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  40.66 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  40.66 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  40.11 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  42.08 
 
 		 195 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  41.53 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  43.27 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  40.11 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  42.51 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  38.16 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  40.88 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  43.3 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  45.56 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  45.56 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  40.88 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  45.28 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  40.12 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  41.18 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  44.76 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  38.2 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  37.64 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  40.46 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  34.81 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  37.84 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  36.13 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  32.95 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  30.32 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  28.39 
 
 		 423 aa  47.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  27.69 
 
 		 420 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  34.38 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 409 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.38 
 
 		 421 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.35 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.94 
 
 		 421 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  35.94 
 
 		 421 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.94 
 
 		 421 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  34.38 
 
 		 420 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  34.33 
 
 		 434 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  36.51 
 
 		 466 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  34.38 
 
 		 421 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  24.24 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.38 
 
 		 420 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.38 
 
 		 420 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  37.08 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  30 
 
 		 465 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  32.86 
 
 		 447 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  30 
 
 		 465 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.51 
 
 		 320 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.51 
 
 		 320 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  27.44 
 
 		 429 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.51 
 
 		 320 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.38 
 
 		 419 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 222 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  45.65 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.88 
 
 		 314 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.11 
 
 		 312 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.99 
 
 		 424 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  36.54 
 
 		 425 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.82 
 
 		 419 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  34.38 
 
 		 419 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.43 
 
 		 419 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  26.22 
 
 		 417 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>