69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0217 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  403  1e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  36.81 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  36.22 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  36.56 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  34.81 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  35.63 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  32.8 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  35.14 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  35.23 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  37.43 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  35.08 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  34.41 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  34.76 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  34.04 
 
 		 1128 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  34.76 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  34.91 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  31.52 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  30.3 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  33.15 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  33.33 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  34.07 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  28.49 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  29.65 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  32.07 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  33.52 
 
 		 209 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  33.33 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  30.33 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  37.65 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  34.09 
 
 		 243 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  35.47 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  33.58 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  29.51 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  26.98 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  31.37 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  31.03 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  27.71 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  37.23 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  31.33 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  27.59 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  30.17 
 
 		 404 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.05 
 
 		 404 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.05 
 
 		 404 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.05 
 
 		 404 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.05 
 
 		 404 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.9 
 
 		 404 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.9 
 
 		 416 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.13 
 
 		 404 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  30.77 
 
 		 404 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  30.77 
 
 		 404 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  26.38 
 
 		 267 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 405 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  47.5 
 
 		 434 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.08 
 
 		 419 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.78 
 
 		 418 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.49 
 
 		 404 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.64 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>