100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0696 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  59.68 
 
 		 188 aa  236  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  45.41 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  46.02 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  43.82 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  44.63 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  48.26 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  50.28 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  47.67 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  46.59 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  45.56 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  47.09 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  41.3 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  46.59 
 
 		 190 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  42.93 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  46.02 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  43.02 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  44.44 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  44.05 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  38.59 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  37.63 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  40.35 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  41.62 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  45.56 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  40.11 
 
 		 1128 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  38.17 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  40.49 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  38.69 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  45.77 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  40.12 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  39.33 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  35.16 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  34.67 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  37.28 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  37.28 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  33.52 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  33.52 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  36.11 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  34 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  28.07 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  29.41 
 
 		 475 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  28.47 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  39.06 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  34.41 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  28.08 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.33 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.33 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.93 
 
 		 316 aa  45.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.58 
 
 		 282 aa  45.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  37.5 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  39.22 
 
 		 420 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.33 
 
 		 315 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  26.54 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.71 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.71 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4541  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  37.1 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  29.69 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.94 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  37.29 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.28 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.21 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 307 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.67 
 
 		 280 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 409 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 199 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 187 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.46 
 
 		 426 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0333  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  35.19 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 350 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  24.72 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000768937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6647  putative protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.26 
 
 		 277 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.72 
 
 		 330 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 		 251 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  30.23 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1135  hypothetical protein  42.22 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.448713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>