114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1670 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  100 
 
 
201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  57.33 
 
 
187 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  52.9 
 
 
194 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  41.04 
 
 
200 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  46.98 
 
 
189 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  39.89 
 
 
196 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  46.05 
 
 
1128 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  40.74 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  44.81 
 
 
196 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 
190 aa  111  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 
190 aa  111  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  45.62 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  40.56 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.26 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  36.67 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  43.38 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  39.06 
 
 
191 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  39.26 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  39.26 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  39.26 
 
 
190 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  39.71 
 
 
195 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  35.62 
 
 
209 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  37.33 
 
 
188 aa  101  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44 
 
 
195 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  39.26 
 
 
196 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  33.8 
 
 
187 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  42.86 
 
 
232 aa  97.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  34 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  36.13 
 
 
185 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  44.62 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  34.31 
 
 
187 aa  92  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  34.31 
 
 
187 aa  92  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  37.43 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  39.42 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  32.67 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  29.11 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  31.37 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  33.77 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  28.39 
 
 
183 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  28.39 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  31.29 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  38.4 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  33.13 
 
 
475 aa  62  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 
248 aa  54.7  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.67 
 
 
243 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 
243 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 
243 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 
249 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.58 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 
251 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 
251 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
238 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.45 
 
 
243 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  31.67 
 
 
256 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.67 
 
 
256 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
243 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
243 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
243 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
256 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
243 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.93 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.25 
 
 
362 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  30.08 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.17 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.83 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.5 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  44.62 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.17 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0567  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>