49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1610 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  71.98 
 
 
188 aa  286  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  45.41 
 
 
211 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  45.41 
 
 
188 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  48.33 
 
 
185 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  44.26 
 
 
196 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  43.48 
 
 
188 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  44.09 
 
 
187 aa  154  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  44.09 
 
 
187 aa  154  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  42.02 
 
 
187 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  40.76 
 
 
200 aa  137  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  39.57 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  39.57 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  39.57 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  38.5 
 
 
190 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  40.12 
 
 
183 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  38.46 
 
 
209 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 
190 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  39.04 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  39.04 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  40.12 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  39.04 
 
 
190 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  42.54 
 
 
190 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.04 
 
 
190 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  39.57 
 
 
190 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  38.42 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  40.12 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  39.25 
 
 
235 aa  128  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  41.21 
 
 
196 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  39.33 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  41.21 
 
 
187 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  37.78 
 
 
1128 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  38.29 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  35.68 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  35.14 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  39.41 
 
 
195 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  36.07 
 
 
200 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  43.17 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  38.04 
 
 
193 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  46.56 
 
 
243 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  37.43 
 
 
232 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  37.5 
 
 
196 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  29.51 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  33.77 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  33.14 
 
 
225 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  29.5 
 
 
475 aa  51.2  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  31.52 
 
 
247 aa  48.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0261  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  25 
 
 
225 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>