84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0153 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  100 
 
 
190 aa  393  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  45.36 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  45.25 
 
 
191 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  44.33 
 
 
195 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  44.26 
 
 
187 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  43.58 
 
 
190 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  43.58 
 
 
190 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  43.58 
 
 
190 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  43.58 
 
 
190 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  46.95 
 
 
189 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  43.58 
 
 
190 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  43.02 
 
 
190 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  43.02 
 
 
190 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  47.83 
 
 
1128 aa  157  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  43.02 
 
 
190 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  43.02 
 
 
190 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  43.02 
 
 
190 aa  156  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  44.05 
 
 
188 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  41.9 
 
 
190 aa  154  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.2 
 
 
195 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  43.45 
 
 
200 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  42.86 
 
 
188 aa  148  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  41.57 
 
 
200 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  42.47 
 
 
196 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  41.8 
 
 
235 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  42.51 
 
 
185 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  40.11 
 
 
193 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  36.56 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  47.59 
 
 
194 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  42.86 
 
 
192 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  42.54 
 
 
182 aa  135  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  38.67 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  42.26 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  40.84 
 
 
243 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  39.23 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  41.9 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  41.9 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  45.39 
 
 
196 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  39.67 
 
 
232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  35.38 
 
 
211 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  40.56 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  35.98 
 
 
181 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  34.07 
 
 
194 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  33.89 
 
 
183 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  34.52 
 
 
225 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  28.32 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  28.12 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  42.19 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  27.22 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  30.21 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.58 
 
 
287 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  43.59 
 
 
210 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  29.17 
 
 
274 aa  45.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  29.41 
 
 
407 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  31.94 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  25.37 
 
 
278 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  24.6 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  40.74 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.78 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.43 
 
 
310 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.78 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.13 
 
 
310 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
293 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  36.23 
 
 
279 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
399 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  26.28 
 
 
261 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
255 aa  42  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.2 
 
 
399 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 
253 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  29.29 
 
 
289 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
186 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  30.22 
 
 
395 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  38.33 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.52 
 
 
277 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  24.82 
 
 
414 aa  41.2  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>